Protein–RNA interactions for Protein: J3QME2

Gm20914, Predicted gene, 20914, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20914J3QME2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20914J3QME2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20914J3QME2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20914J3QME2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20914J3QME2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20914J3QME2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20914J3QME2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20914J3QME2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20914J3QME2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20914J3QME2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20914J3QME2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20914J3QME2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm20914J3QME2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm20914J3QME2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm20914J3QME2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20914J3QME2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20914J3QME2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20914J3QME2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20914J3QME2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20914J3QME2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20914J3QME2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20914J3QME2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20914J3QME2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20914J3QME2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20914J3QME2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20914J3QME2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20914J3QME2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20914J3QME2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20914J3QME2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20914J3QME2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20914J3QME2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20914J3QME2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20914J3QME2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20914J3QME2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20914J3QME2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20914J3QME2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20914J3QME2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20914J3QME2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20914J3QME2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20914J3QME2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20914J3QME2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20914J3QME2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20914J3QME2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20914J3QME2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20914J3QME2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20914J3QME2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20914J3QME2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20914J3QME2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20914J3QME2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20914J3QME2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20914J3QME2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20914J3QME2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20914J3QME2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20914J3QME2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20914J3QME2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20914J3QME2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20914J3QME2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20914J3QME2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20914J3QME2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20914J3QME2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20914J3QME2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20914J3QME2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20914J3QME2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20914J3QME2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20914J3QME2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20914J3QME2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20914J3QME2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20914J3QME2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20914J3QME2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20914J3QME2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20914J3QME2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20914J3QME2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20914J3QME2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20914J3QME2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20914J3QME2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20914J3QME2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20914J3QME2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20914J3QME2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20914J3QME2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20914J3QME2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20914J3QME2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm20914J3QME2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm20914J3QME2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm20914J3QME2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20914J3QME2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20914J3QME2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20914J3QME2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20914J3QME2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20914J3QME2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20914J3QME2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20914J3QME2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20914J3QME2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20914J3QME2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20914J3QME2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20914J3QME2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20914J3QME2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20914J3QME2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20914J3QME2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20914J3QME2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20914J3QME2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms