Protein–RNA interactions for Protein: J3QM76

Ccdc179, Coiled-coil domain-containing protein 179, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc179J3QM76 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc179J3QM76 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc179J3QM76 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc179J3QM76 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc179J3QM76 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc179J3QM76 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc179J3QM76 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc179J3QM76 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc179J3QM76 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc179J3QM76 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc179J3QM76 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc179J3QM76 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc179J3QM76 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc179J3QM76 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc179J3QM76 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc179J3QM76 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc179J3QM76 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc179J3QM76 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc179J3QM76 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc179J3QM76 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc179J3QM76 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc179J3QM76 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc179J3QM76 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc179J3QM76 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc179J3QM76 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc179J3QM76 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc179J3QM76 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc179J3QM76 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc179J3QM76 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc179J3QM76 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc179J3QM76 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc179J3QM76 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc179J3QM76 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc179J3QM76 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc179J3QM76 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc179J3QM76 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc179J3QM76 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc179J3QM76 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc179J3QM76 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc179J3QM76 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc179J3QM76 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc179J3QM76 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc179J3QM76 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc179J3QM76 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc179J3QM76 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc179J3QM76 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc179J3QM76 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc179J3QM76 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc179J3QM76 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc179J3QM76 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc179J3QM76 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc179J3QM76 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc179J3QM76 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc179J3QM76 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc179J3QM76 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc179J3QM76 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc179J3QM76 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc179J3QM76 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc179J3QM76 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc179J3QM76 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc179J3QM76 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc179J3QM76 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc179J3QM76 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc179J3QM76 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc179J3QM76 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc179J3QM76 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc179J3QM76 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc179J3QM76 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc179J3QM76 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc179J3QM76 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc179J3QM76 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc179J3QM76 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc179J3QM76 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc179J3QM76 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc179J3QM76 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc179J3QM76 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc179J3QM76 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc179J3QM76 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc179J3QM76 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc179J3QM76 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc179J3QM76 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc179J3QM76 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc179J3QM76 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc179J3QM76 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc179J3QM76 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc179J3QM76 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc179J3QM76 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc179J3QM76 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc179J3QM76 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc179J3QM76 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc179J3QM76 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc179J3QM76 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc179J3QM76 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc179J3QM76 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc179J3QM76 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc179J3QM76 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc179J3QM76 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc179J3QM76 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc179J3QM76 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc179J3QM76 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms