Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zfp408H7BX78 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Zfp408H7BX78 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zfp408H7BX78 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zfp408H7BX78 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Zfp408H7BX78 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Zfp408H7BX78 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Zfp408H7BX78 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Zfp408H7BX78 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Zfp408H7BX78 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Zfp408H7BX78 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Zfp408H7BX78 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Zfp408H7BX78 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Zfp408H7BX78 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Zfp408H7BX78 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zfp408H7BX78 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Zfp408H7BX78 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Zfp408H7BX78 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Zfp408H7BX78 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Zfp408H7BX78 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zfp408H7BX78 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zfp408H7BX78 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zfp408H7BX78 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zfp408H7BX78 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Zfp408H7BX78 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zfp408H7BX78 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zfp408H7BX78 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zfp408H7BX78 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zfp408H7BX78 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zfp408H7BX78 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Zfp408H7BX78 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Zfp408H7BX78 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Zfp408H7BX78 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Zfp408H7BX78 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zfp408H7BX78 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Zfp408H7BX78 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Zfp408H7BX78 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zfp408H7BX78 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zfp408H7BX78 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zfp408H7BX78 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zfp408H7BX78 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Zfp408H7BX78 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Zfp408H7BX78 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Zfp408H7BX78 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Zfp408H7BX78 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Zfp408H7BX78 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Zfp408H7BX78 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Zfp408H7BX78 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Zfp408H7BX78 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Zfp408H7BX78 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Zfp408H7BX78 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zfp408H7BX78 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zfp408H7BX78 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Zfp408H7BX78 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Zfp408H7BX78 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Zfp408H7BX78 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Zfp408H7BX78 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Zfp408H7BX78 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zfp408H7BX78 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Zfp408H7BX78 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Zfp408H7BX78 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Zfp408H7BX78 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Zfp408H7BX78 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zfp408H7BX78 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zfp408H7BX78 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zfp408H7BX78 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zfp408H7BX78 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zfp408H7BX78 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zfp408H7BX78 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zfp408H7BX78 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zfp408H7BX78 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zfp408H7BX78 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zfp408H7BX78 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Zfp408H7BX78 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zfp408H7BX78 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Zfp408H7BX78 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zfp408H7BX78 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zfp408H7BX78 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zfp408H7BX78 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zfp408H7BX78 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zfp408H7BX78 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Zfp408H7BX78 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zfp408H7BX78 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Zfp408H7BX78 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Zfp408H7BX78 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Zfp408H7BX78 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Zfp408H7BX78 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Zfp408H7BX78 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Zfp408H7BX78 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Zfp408H7BX78 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Zfp408H7BX78 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Zfp408H7BX78 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zfp408H7BX78 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zfp408H7BX78 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zfp408H7BX78 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zfp408H7BX78 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zfp408H7BX78 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zfp408H7BX78 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zfp408H7BX78 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zfp408H7BX78 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms