Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pot1bH7BX60 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pot1bH7BX60 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pot1bH7BX60 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pot1bH7BX60 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pot1bH7BX60 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pot1bH7BX60 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pot1bH7BX60 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pot1bH7BX60 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pot1bH7BX60 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pot1bH7BX60 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pot1bH7BX60 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pot1bH7BX60 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Pot1bH7BX60 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pot1bH7BX60 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pot1bH7BX60 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pot1bH7BX60 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pot1bH7BX60 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pot1bH7BX60 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pot1bH7BX60 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Pot1bH7BX60 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pot1bH7BX60 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pot1bH7BX60 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pot1bH7BX60 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pot1bH7BX60 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pot1bH7BX60 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pot1bH7BX60 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pot1bH7BX60 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pot1bH7BX60 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pot1bH7BX60 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pot1bH7BX60 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pot1bH7BX60 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pot1bH7BX60 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pot1bH7BX60 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pot1bH7BX60 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pot1bH7BX60 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pot1bH7BX60 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pot1bH7BX60 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pot1bH7BX60 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pot1bH7BX60 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pot1bH7BX60 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pot1bH7BX60 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pot1bH7BX60 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pot1bH7BX60 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pot1bH7BX60 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pot1bH7BX60 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pot1bH7BX60 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pot1bH7BX60 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pot1bH7BX60 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pot1bH7BX60 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pot1bH7BX60 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pot1bH7BX60 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pot1bH7BX60 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pot1bH7BX60 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pot1bH7BX60 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pot1bH7BX60 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pot1bH7BX60 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pot1bH7BX60 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pot1bH7BX60 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pot1bH7BX60 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pot1bH7BX60 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pot1bH7BX60 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pot1bH7BX60 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pot1bH7BX60 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pot1bH7BX60 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pot1bH7BX60 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pot1bH7BX60 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pot1bH7BX60 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pot1bH7BX60 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pot1bH7BX60 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pot1bH7BX60 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pot1bH7BX60 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pot1bH7BX60 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pot1bH7BX60 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pot1bH7BX60 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pot1bH7BX60 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pot1bH7BX60 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pot1bH7BX60 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pot1bH7BX60 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pot1bH7BX60 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pot1bH7BX60 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pot1bH7BX60 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pot1bH7BX60 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pot1bH7BX60 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pot1bH7BX60 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pot1bH7BX60 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pot1bH7BX60 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pot1bH7BX60 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pot1bH7BX60 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pot1bH7BX60 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pot1bH7BX60 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pot1bH7BX60 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pot1bH7BX60 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pot1bH7BX60 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pot1bH7BX60 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pot1bH7BX60 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pot1bH7BX60 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pot1bH7BX60 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pot1bH7BX60 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pot1bH7BX60 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms