Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sclt1G5E861 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sclt1G5E861 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sclt1G5E861 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sclt1G5E861 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sclt1G5E861 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sclt1G5E861 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sclt1G5E861 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sclt1G5E861 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sclt1G5E861 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sclt1G5E861 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sclt1G5E861 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sclt1G5E861 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sclt1G5E861 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sclt1G5E861 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sclt1G5E861 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Sclt1G5E861 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sclt1G5E861 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sclt1G5E861 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sclt1G5E861 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sclt1G5E861 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sclt1G5E861 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sclt1G5E861 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Sclt1G5E861 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sclt1G5E861 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sclt1G5E861 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Sclt1G5E861 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sclt1G5E861 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sclt1G5E861 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sclt1G5E861 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sclt1G5E861 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sclt1G5E861 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sclt1G5E861 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sclt1G5E861 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sclt1G5E861 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sclt1G5E861 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sclt1G5E861 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sclt1G5E861 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sclt1G5E861 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Sclt1G5E861 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sclt1G5E861 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sclt1G5E861 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sclt1G5E861 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sclt1G5E861 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sclt1G5E861 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sclt1G5E861 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Sclt1G5E861 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Sclt1G5E861 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sclt1G5E861 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Sclt1G5E861 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Sclt1G5E861 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sclt1G5E861 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sclt1G5E861 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sclt1G5E861 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sclt1G5E861 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sclt1G5E861 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sclt1G5E861 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sclt1G5E861 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sclt1G5E861 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sclt1G5E861 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sclt1G5E861 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sclt1G5E861 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sclt1G5E861 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sclt1G5E861 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sclt1G5E861 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sclt1G5E861 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sclt1G5E861 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sclt1G5E861 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sclt1G5E861 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sclt1G5E861 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sclt1G5E861 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sclt1G5E861 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sclt1G5E861 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Sclt1G5E861 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Sclt1G5E861 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Sclt1G5E861 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sclt1G5E861 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sclt1G5E861 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sclt1G5E861 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sclt1G5E861 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sclt1G5E861 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sclt1G5E861 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sclt1G5E861 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sclt1G5E861 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sclt1G5E861 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sclt1G5E861 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sclt1G5E861 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sclt1G5E861 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sclt1G5E861 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sclt1G5E861 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sclt1G5E861 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sclt1G5E861 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sclt1G5E861 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sclt1G5E861 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sclt1G5E861 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sclt1G5E861 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sclt1G5E861 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sclt1G5E861 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sclt1G5E861 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sclt1G5E861 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms