Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim55G3X8Y1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim55G3X8Y1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim55G3X8Y1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim55G3X8Y1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim55G3X8Y1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim55G3X8Y1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim55G3X8Y1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim55G3X8Y1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim55G3X8Y1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim55G3X8Y1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim55G3X8Y1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim55G3X8Y1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim55G3X8Y1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim55G3X8Y1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim55G3X8Y1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trim55G3X8Y1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim55G3X8Y1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim55G3X8Y1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim55G3X8Y1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim55G3X8Y1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim55G3X8Y1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim55G3X8Y1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim55G3X8Y1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim55G3X8Y1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim55G3X8Y1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim55G3X8Y1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim55G3X8Y1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim55G3X8Y1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim55G3X8Y1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim55G3X8Y1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim55G3X8Y1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim55G3X8Y1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim55G3X8Y1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim55G3X8Y1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim55G3X8Y1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim55G3X8Y1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim55G3X8Y1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim55G3X8Y1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim55G3X8Y1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim55G3X8Y1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim55G3X8Y1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim55G3X8Y1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim55G3X8Y1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim55G3X8Y1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim55G3X8Y1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim55G3X8Y1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim55G3X8Y1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim55G3X8Y1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim55G3X8Y1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim55G3X8Y1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim55G3X8Y1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim55G3X8Y1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim55G3X8Y1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trim55G3X8Y1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim55G3X8Y1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim55G3X8Y1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim55G3X8Y1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim55G3X8Y1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim55G3X8Y1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim55G3X8Y1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim55G3X8Y1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim55G3X8Y1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim55G3X8Y1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim55G3X8Y1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim55G3X8Y1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim55G3X8Y1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim55G3X8Y1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim55G3X8Y1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim55G3X8Y1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim55G3X8Y1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim55G3X8Y1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim55G3X8Y1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim55G3X8Y1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim55G3X8Y1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim55G3X8Y1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim55G3X8Y1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim55G3X8Y1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim55G3X8Y1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim55G3X8Y1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim55G3X8Y1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim55G3X8Y1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim55G3X8Y1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim55G3X8Y1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim55G3X8Y1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim55G3X8Y1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim55G3X8Y1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim55G3X8Y1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim55G3X8Y1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim55G3X8Y1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim55G3X8Y1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim55G3X8Y1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim55G3X8Y1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim55G3X8Y1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim55G3X8Y1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim55G3X8Y1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim55G3X8Y1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim55G3X8Y1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim55G3X8Y1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim55G3X8Y1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms