Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK0

Ttc37, Tetratricopeptide repeat domain 37, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc37F8VPK0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Ttc37F8VPK0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Ttc37F8VPK0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Ttc37F8VPK0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Ttc37F8VPK0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Ttc37F8VPK0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Ttc37F8VPK0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Ttc37F8VPK0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Ttc37F8VPK0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Ttc37F8VPK0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Ttc37F8VPK0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Ttc37F8VPK0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Ttc37F8VPK0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Ttc37F8VPK0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
Ttc37F8VPK0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Ttc37F8VPK0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Ttc37F8VPK0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Ttc37F8VPK0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Ttc37F8VPK0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Ttc37F8VPK0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Ttc37F8VPK0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Ttc37F8VPK0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Ttc37F8VPK0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Ttc37F8VPK0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Ttc37F8VPK0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Ttc37F8VPK0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Ttc37F8VPK0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Ttc37F8VPK0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
Ttc37F8VPK0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Ttc37F8VPK0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Ttc37F8VPK0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Ttc37F8VPK0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Ttc37F8VPK0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
Ttc37F8VPK0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
Ttc37F8VPK0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Ttc37F8VPK0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Ttc37F8VPK0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
Ttc37F8VPK0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
Ttc37F8VPK0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Ttc37F8VPK0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Ttc37F8VPK0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Ttc37F8VPK0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Ttc37F8VPK0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Ttc37F8VPK0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Ttc37F8VPK0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Ttc37F8VPK0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Ttc37F8VPK0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Ttc37F8VPK0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Ttc37F8VPK0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Ttc37F8VPK0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Ttc37F8VPK0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Ttc37F8VPK0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Ttc37F8VPK0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Ttc37F8VPK0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Ttc37F8VPK0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Ttc37F8VPK0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Ttc37F8VPK0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Ttc37F8VPK0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Ttc37F8VPK0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Ttc37F8VPK0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Ttc37F8VPK0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Ttc37F8VPK0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Ttc37F8VPK0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Ttc37F8VPK0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Ttc37F8VPK0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Ttc37F8VPK0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
Ttc37F8VPK0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Ttc37F8VPK0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC37.63■■■■□ 3.62
Ttc37F8VPK0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Ttc37F8VPK0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Ttc37F8VPK0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Ttc37F8VPK0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Ttc37F8VPK0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
Ttc37F8VPK0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Ttc37F8VPK0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Ttc37F8VPK0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Ttc37F8VPK0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
Ttc37F8VPK0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Ttc37F8VPK0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Ttc37F8VPK0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Ttc37F8VPK0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Ttc37F8VPK0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
Ttc37F8VPK0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Ttc37F8VPK0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Ttc37F8VPK0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Ttc37F8VPK0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Ttc37F8VPK0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Ttc37F8VPK0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC37.51■■■■□ 3.59
Ttc37F8VPK0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Ttc37F8VPK0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
Ttc37F8VPK0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Ttc37F8VPK0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Ttc37F8VPK0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
Ttc37F8VPK0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Ttc37F8VPK0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
Ttc37F8VPK0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Ttc37F8VPK0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Ttc37F8VPK0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Ttc37F8VPK0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Ttc37F8VPK0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms