Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rfx7F8VPJ6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rfx7F8VPJ6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rfx7F8VPJ6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Rfx7F8VPJ6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Rfx7F8VPJ6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Rfx7F8VPJ6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Rfx7F8VPJ6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Rfx7F8VPJ6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Rfx7F8VPJ6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Rfx7F8VPJ6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Rfx7F8VPJ6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Rfx7F8VPJ6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Rfx7F8VPJ6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Rfx7F8VPJ6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Rfx7F8VPJ6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Rfx7F8VPJ6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Rfx7F8VPJ6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Rfx7F8VPJ6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Rfx7F8VPJ6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Rfx7F8VPJ6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Rfx7F8VPJ6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Rfx7F8VPJ6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Rfx7F8VPJ6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
Rfx7F8VPJ6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Rfx7F8VPJ6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rfx7F8VPJ6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rfx7F8VPJ6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Rfx7F8VPJ6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Rfx7F8VPJ6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Rfx7F8VPJ6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Rfx7F8VPJ6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Rfx7F8VPJ6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Rfx7F8VPJ6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Rfx7F8VPJ6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Rfx7F8VPJ6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rfx7F8VPJ6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Rfx7F8VPJ6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Rfx7F8VPJ6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
Rfx7F8VPJ6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
Rfx7F8VPJ6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Rfx7F8VPJ6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Rfx7F8VPJ6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Rfx7F8VPJ6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Rfx7F8VPJ6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Rfx7F8VPJ6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Rfx7F8VPJ6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Rfx7F8VPJ6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Rfx7F8VPJ6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Rfx7F8VPJ6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Rfx7F8VPJ6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Rfx7F8VPJ6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Rfx7F8VPJ6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Rfx7F8VPJ6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Rfx7F8VPJ6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Rfx7F8VPJ6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Rfx7F8VPJ6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
Rfx7F8VPJ6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
Rfx7F8VPJ6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Rfx7F8VPJ6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Rfx7F8VPJ6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Rfx7F8VPJ6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Rfx7F8VPJ6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Rfx7F8VPJ6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rfx7F8VPJ6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rfx7F8VPJ6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Rfx7F8VPJ6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Rfx7F8VPJ6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Rfx7F8VPJ6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.35
Rfx7F8VPJ6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Rfx7F8VPJ6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Rfx7F8VPJ6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Rfx7F8VPJ6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Rfx7F8VPJ6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Rfx7F8VPJ6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
Rfx7F8VPJ6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Rfx7F8VPJ6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Rfx7F8VPJ6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Rfx7F8VPJ6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Rfx7F8VPJ6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Rfx7F8VPJ6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Rfx7F8VPJ6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Rfx7F8VPJ6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Rfx7F8VPJ6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Rfx7F8VPJ6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Rfx7F8VPJ6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Rfx7F8VPJ6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Rfx7F8VPJ6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Rfx7F8VPJ6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Rfx7F8VPJ6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Rfx7F8VPJ6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
Rfx7F8VPJ6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rfx7F8VPJ6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rfx7F8VPJ6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rfx7F8VPJ6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Rfx7F8VPJ6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Rfx7F8VPJ6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Rfx7F8VPJ6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Rfx7F8VPJ6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Rfx7F8VPJ6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms