Protein–RNA interactions for Protein: F6SKY8

Gm3072, Predicted gene 3072 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3072F6SKY8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3072F6SKY8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3072F6SKY8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3072F6SKY8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3072F6SKY8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3072F6SKY8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3072F6SKY8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3072F6SKY8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3072F6SKY8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm3072F6SKY8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm3072F6SKY8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm3072F6SKY8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm3072F6SKY8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3072F6SKY8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3072F6SKY8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3072F6SKY8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm3072F6SKY8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3072F6SKY8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3072F6SKY8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3072F6SKY8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3072F6SKY8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3072F6SKY8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3072F6SKY8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm3072F6SKY8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3072F6SKY8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3072F6SKY8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3072F6SKY8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm3072F6SKY8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3072F6SKY8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3072F6SKY8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm3072F6SKY8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3072F6SKY8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3072F6SKY8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3072F6SKY8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3072F6SKY8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm3072F6SKY8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm3072F6SKY8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm3072F6SKY8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm3072F6SKY8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm3072F6SKY8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm3072F6SKY8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm3072F6SKY8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3072F6SKY8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3072F6SKY8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3072F6SKY8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3072F6SKY8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3072F6SKY8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm3072F6SKY8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm3072F6SKY8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm3072F6SKY8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm3072F6SKY8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm3072F6SKY8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm3072F6SKY8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm3072F6SKY8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm3072F6SKY8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3072F6SKY8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3072F6SKY8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3072F6SKY8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3072F6SKY8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm3072F6SKY8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm3072F6SKY8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm3072F6SKY8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm3072F6SKY8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm3072F6SKY8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3072F6SKY8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3072F6SKY8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3072F6SKY8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm3072F6SKY8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3072F6SKY8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3072F6SKY8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3072F6SKY8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3072F6SKY8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3072F6SKY8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3072F6SKY8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3072F6SKY8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3072F6SKY8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3072F6SKY8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3072F6SKY8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3072F6SKY8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3072F6SKY8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3072F6SKY8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3072F6SKY8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3072F6SKY8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3072F6SKY8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3072F6SKY8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3072F6SKY8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3072F6SKY8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3072F6SKY8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3072F6SKY8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3072F6SKY8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3072F6SKY8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3072F6SKY8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3072F6SKY8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3072F6SKY8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3072F6SKY8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3072F6SKY8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3072F6SKY8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm3072F6SKY8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm3072F6SKY8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm3072F6SKY8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms