Protein–RNA interactions for Protein: E9QAE1

Nckap5, NCK-associated protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5E9QAE1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nckap5E9QAE1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nckap5E9QAE1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nckap5E9QAE1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nckap5E9QAE1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nckap5E9QAE1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nckap5E9QAE1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nckap5E9QAE1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nckap5E9QAE1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nckap5E9QAE1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nckap5E9QAE1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nckap5E9QAE1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nckap5E9QAE1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nckap5E9QAE1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nckap5E9QAE1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nckap5E9QAE1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nckap5E9QAE1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nckap5E9QAE1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nckap5E9QAE1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nckap5E9QAE1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nckap5E9QAE1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nckap5E9QAE1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nckap5E9QAE1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nckap5E9QAE1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nckap5E9QAE1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nckap5E9QAE1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nckap5E9QAE1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nckap5E9QAE1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nckap5E9QAE1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nckap5E9QAE1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nckap5E9QAE1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nckap5E9QAE1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nckap5E9QAE1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nckap5E9QAE1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nckap5E9QAE1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nckap5E9QAE1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nckap5E9QAE1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nckap5E9QAE1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nckap5E9QAE1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nckap5E9QAE1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nckap5E9QAE1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nckap5E9QAE1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nckap5E9QAE1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nckap5E9QAE1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nckap5E9QAE1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nckap5E9QAE1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nckap5E9QAE1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nckap5E9QAE1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Nckap5E9QAE1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nckap5E9QAE1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nckap5E9QAE1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nckap5E9QAE1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nckap5E9QAE1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nckap5E9QAE1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Nckap5E9QAE1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nckap5E9QAE1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nckap5E9QAE1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nckap5E9QAE1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nckap5E9QAE1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nckap5E9QAE1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nckap5E9QAE1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nckap5E9QAE1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nckap5E9QAE1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nckap5E9QAE1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nckap5E9QAE1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nckap5E9QAE1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nckap5E9QAE1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nckap5E9QAE1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nckap5E9QAE1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nckap5E9QAE1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nckap5E9QAE1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nckap5E9QAE1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nckap5E9QAE1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nckap5E9QAE1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nckap5E9QAE1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nckap5E9QAE1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nckap5E9QAE1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nckap5E9QAE1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nckap5E9QAE1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nckap5E9QAE1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nckap5E9QAE1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nckap5E9QAE1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nckap5E9QAE1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nckap5E9QAE1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nckap5E9QAE1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nckap5E9QAE1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nckap5E9QAE1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nckap5E9QAE1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nckap5E9QAE1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nckap5E9QAE1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nckap5E9QAE1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nckap5E9QAE1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nckap5E9QAE1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nckap5E9QAE1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nckap5E9QAE1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nckap5E9QAE1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nckap5E9QAE1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nckap5E9QAE1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nckap5E9QAE1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nckap5E9QAE1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms