Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
Urb2E9Q7L1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Urb2E9Q7L1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Urb2E9Q7L1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Urb2E9Q7L1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
Urb2E9Q7L1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Urb2E9Q7L1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Urb2E9Q7L1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC41.04■■■■■ 4.16
Urb2E9Q7L1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
Urb2E9Q7L1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
Urb2E9Q7L1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC41.03■■■■■ 4.16
Urb2E9Q7L1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Urb2E9Q7L1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Urb2E9Q7L1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
Urb2E9Q7L1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC40.99■■■■■ 4.15
Urb2E9Q7L1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
Urb2E9Q7L1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Urb2E9Q7L1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC40.95■■■■■ 4.15
Urb2E9Q7L1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
Urb2E9Q7L1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
Urb2E9Q7L1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
Urb2E9Q7L1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Urb2E9Q7L1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
Urb2E9Q7L1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
Urb2E9Q7L1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
Urb2E9Q7L1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Urb2E9Q7L1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Urb2E9Q7L1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
Urb2E9Q7L1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
Urb2E9Q7L1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Urb2E9Q7L1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Urb2E9Q7L1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Urb2E9Q7L1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Urb2E9Q7L1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.12
Urb2E9Q7L1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.12
Urb2E9Q7L1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC40.82■■■■■ 4.12
Urb2E9Q7L1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Urb2E9Q7L1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC40.78■■■■■ 4.12
Urb2E9Q7L1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Urb2E9Q7L1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Urb2E9Q7L1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Urb2E9Q7L1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Urb2E9Q7L1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
Urb2E9Q7L1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC40.75■■■■■ 4.11
Urb2E9Q7L1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
Urb2E9Q7L1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Urb2E9Q7L1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Urb2E9Q7L1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Urb2E9Q7L1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Urb2E9Q7L1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Urb2E9Q7L1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Urb2E9Q7L1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC40.71■■■■■ 4.11
Urb2E9Q7L1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Urb2E9Q7L1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
Urb2E9Q7L1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Urb2E9Q7L1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Urb2E9Q7L1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Urb2E9Q7L1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
Urb2E9Q7L1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
Urb2E9Q7L1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
Urb2E9Q7L1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
Urb2E9Q7L1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
Urb2E9Q7L1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Urb2E9Q7L1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Urb2E9Q7L1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Urb2E9Q7L1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Urb2E9Q7L1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Urb2E9Q7L1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Urb2E9Q7L1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC40.57■■■■■ 4.08
Urb2E9Q7L1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Urb2E9Q7L1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Urb2E9Q7L1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Urb2E9Q7L1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Urb2E9Q7L1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Urb2E9Q7L1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
Urb2E9Q7L1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC40.52■■■■■ 4.08
Urb2E9Q7L1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Urb2E9Q7L1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Urb2E9Q7L1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Urb2E9Q7L1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Urb2E9Q7L1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Urb2E9Q7L1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Urb2E9Q7L1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Urb2E9Q7L1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Urb2E9Q7L1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Urb2E9Q7L1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Urb2E9Q7L1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Urb2E9Q7L1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Urb2E9Q7L1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Urb2E9Q7L1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Urb2E9Q7L1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Urb2E9Q7L1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Urb2E9Q7L1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
Urb2E9Q7L1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Urb2E9Q7L1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Urb2E9Q7L1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Urb2E9Q7L1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
Urb2E9Q7L1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Urb2E9Q7L1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
Urb2E9Q7L1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms