Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R1

Itga10, Integrin, alpha 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga10E9Q6R1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga10E9Q6R1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga10E9Q6R1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga10E9Q6R1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga10E9Q6R1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itga10E9Q6R1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itga10E9Q6R1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itga10E9Q6R1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itga10E9Q6R1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itga10E9Q6R1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itga10E9Q6R1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga10E9Q6R1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga10E9Q6R1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga10E9Q6R1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Itga10E9Q6R1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga10E9Q6R1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga10E9Q6R1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga10E9Q6R1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga10E9Q6R1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itga10E9Q6R1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itga10E9Q6R1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga10E9Q6R1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga10E9Q6R1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itga10E9Q6R1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga10E9Q6R1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga10E9Q6R1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itga10E9Q6R1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itga10E9Q6R1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itga10E9Q6R1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itga10E9Q6R1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itga10E9Q6R1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itga10E9Q6R1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itga10E9Q6R1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga10E9Q6R1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itga10E9Q6R1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Itga10E9Q6R1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itga10E9Q6R1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itga10E9Q6R1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga10E9Q6R1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga10E9Q6R1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga10E9Q6R1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga10E9Q6R1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga10E9Q6R1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga10E9Q6R1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga10E9Q6R1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga10E9Q6R1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga10E9Q6R1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga10E9Q6R1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga10E9Q6R1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga10E9Q6R1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga10E9Q6R1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga10E9Q6R1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga10E9Q6R1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Itga10E9Q6R1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itga10E9Q6R1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itga10E9Q6R1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga10E9Q6R1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga10E9Q6R1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga10E9Q6R1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga10E9Q6R1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itga10E9Q6R1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itga10E9Q6R1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itga10E9Q6R1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itga10E9Q6R1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itga10E9Q6R1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itga10E9Q6R1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga10E9Q6R1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga10E9Q6R1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga10E9Q6R1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga10E9Q6R1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Itga10E9Q6R1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itga10E9Q6R1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itga10E9Q6R1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itga10E9Q6R1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itga10E9Q6R1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itga10E9Q6R1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Itga10E9Q6R1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itga10E9Q6R1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga10E9Q6R1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga10E9Q6R1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga10E9Q6R1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga10E9Q6R1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga10E9Q6R1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga10E9Q6R1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga10E9Q6R1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga10E9Q6R1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga10E9Q6R1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga10E9Q6R1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga10E9Q6R1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga10E9Q6R1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itga10E9Q6R1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itga10E9Q6R1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itga10E9Q6R1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itga10E9Q6R1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itga10E9Q6R1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itga10E9Q6R1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itga10E9Q6R1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itga10E9Q6R1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga10E9Q6R1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga10E9Q6R1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms