Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm20518E9Q548 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20518E9Q548 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20518E9Q548 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20518E9Q548 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20518E9Q548 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20518E9Q548 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm20518E9Q548 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20518E9Q548 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20518E9Q548 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20518E9Q548 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20518E9Q548 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20518E9Q548 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20518E9Q548 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm20518E9Q548 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm20518E9Q548 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm20518E9Q548 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20518E9Q548 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20518E9Q548 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20518E9Q548 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20518E9Q548 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20518E9Q548 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20518E9Q548 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20518E9Q548 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20518E9Q548 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm20518E9Q548 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm20518E9Q548 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm20518E9Q548 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm20518E9Q548 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm20518E9Q548 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm20518E9Q548 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm20518E9Q548 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm20518E9Q548 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm20518E9Q548 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm20518E9Q548 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm20518E9Q548 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm20518E9Q548 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm20518E9Q548 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm20518E9Q548 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm20518E9Q548 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm20518E9Q548 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm20518E9Q548 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm20518E9Q548 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm20518E9Q548 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm20518E9Q548 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm20518E9Q548 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm20518E9Q548 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm20518E9Q548 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm20518E9Q548 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm20518E9Q548 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm20518E9Q548 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm20518E9Q548 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm20518E9Q548 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm20518E9Q548 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm20518E9Q548 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm20518E9Q548 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm20518E9Q548 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm20518E9Q548 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm20518E9Q548 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm20518E9Q548 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm20518E9Q548 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm20518E9Q548 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm20518E9Q548 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm20518E9Q548 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm20518E9Q548 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm20518E9Q548 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm20518E9Q548 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm20518E9Q548 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm20518E9Q548 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm20518E9Q548 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm20518E9Q548 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm20518E9Q548 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm20518E9Q548 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm20518E9Q548 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm20518E9Q548 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm20518E9Q548 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm20518E9Q548 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm20518E9Q548 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm20518E9Q548 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm20518E9Q548 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm20518E9Q548 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm20518E9Q548 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm20518E9Q548 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm20518E9Q548 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm20518E9Q548 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm20518E9Q548 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm20518E9Q548 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm20518E9Q548 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm20518E9Q548 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm20518E9Q548 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm20518E9Q548 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm20518E9Q548 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm20518E9Q548 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm20518E9Q548 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm20518E9Q548 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm20518E9Q548 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm20518E9Q548 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm20518E9Q548 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm20518E9Q548 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gm20518E9Q548 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms