Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3J7

Gm3020, Predicted gene 3020, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3020E9Q3J7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3020E9Q3J7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3020E9Q3J7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3020E9Q3J7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3020E9Q3J7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3020E9Q3J7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3020E9Q3J7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3020E9Q3J7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm3020E9Q3J7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3020E9Q3J7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3020E9Q3J7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3020E9Q3J7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3020E9Q3J7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3020E9Q3J7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3020E9Q3J7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3020E9Q3J7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3020E9Q3J7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3020E9Q3J7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3020E9Q3J7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3020E9Q3J7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3020E9Q3J7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3020E9Q3J7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3020E9Q3J7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3020E9Q3J7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3020E9Q3J7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3020E9Q3J7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm3020E9Q3J7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm3020E9Q3J7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm3020E9Q3J7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3020E9Q3J7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3020E9Q3J7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3020E9Q3J7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3020E9Q3J7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3020E9Q3J7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3020E9Q3J7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3020E9Q3J7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3020E9Q3J7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3020E9Q3J7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm3020E9Q3J7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3020E9Q3J7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3020E9Q3J7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3020E9Q3J7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3020E9Q3J7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3020E9Q3J7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3020E9Q3J7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3020E9Q3J7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3020E9Q3J7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3020E9Q3J7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3020E9Q3J7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3020E9Q3J7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3020E9Q3J7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3020E9Q3J7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3020E9Q3J7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3020E9Q3J7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3020E9Q3J7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3020E9Q3J7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3020E9Q3J7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3020E9Q3J7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3020E9Q3J7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3020E9Q3J7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3020E9Q3J7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3020E9Q3J7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3020E9Q3J7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3020E9Q3J7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3020E9Q3J7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3020E9Q3J7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3020E9Q3J7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3020E9Q3J7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3020E9Q3J7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3020E9Q3J7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3020E9Q3J7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3020E9Q3J7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3020E9Q3J7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3020E9Q3J7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3020E9Q3J7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3020E9Q3J7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3020E9Q3J7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3020E9Q3J7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3020E9Q3J7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3020E9Q3J7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3020E9Q3J7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3020E9Q3J7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3020E9Q3J7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3020E9Q3J7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3020E9Q3J7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3020E9Q3J7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3020E9Q3J7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3020E9Q3J7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3020E9Q3J7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3020E9Q3J7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3020E9Q3J7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3020E9Q3J7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3020E9Q3J7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3020E9Q3J7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3020E9Q3J7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3020E9Q3J7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3020E9Q3J7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3020E9Q3J7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3020E9Q3J7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3020E9Q3J7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms