Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ36

Pkhd1, Polycystic kidney and hepatic disease 1, mousemouse

Predictions only

Length 4,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1E9PZ36 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkhd1E9PZ36 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkhd1E9PZ36 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkhd1E9PZ36 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkhd1E9PZ36 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkhd1E9PZ36 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkhd1E9PZ36 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkhd1E9PZ36 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkhd1E9PZ36 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkhd1E9PZ36 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkhd1E9PZ36 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkhd1E9PZ36 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkhd1E9PZ36 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkhd1E9PZ36 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkhd1E9PZ36 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkhd1E9PZ36 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkhd1E9PZ36 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkhd1E9PZ36 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkhd1E9PZ36 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkhd1E9PZ36 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkhd1E9PZ36 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkhd1E9PZ36 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkhd1E9PZ36 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkhd1E9PZ36 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkhd1E9PZ36 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkhd1E9PZ36 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkhd1E9PZ36 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkhd1E9PZ36 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkhd1E9PZ36 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkhd1E9PZ36 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkhd1E9PZ36 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkhd1E9PZ36 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkhd1E9PZ36 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkhd1E9PZ36 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkhd1E9PZ36 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkhd1E9PZ36 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkhd1E9PZ36 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkhd1E9PZ36 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkhd1E9PZ36 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkhd1E9PZ36 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkhd1E9PZ36 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkhd1E9PZ36 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkhd1E9PZ36 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkhd1E9PZ36 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkhd1E9PZ36 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkhd1E9PZ36 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkhd1E9PZ36 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkhd1E9PZ36 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkhd1E9PZ36 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkhd1E9PZ36 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkhd1E9PZ36 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkhd1E9PZ36 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkhd1E9PZ36 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkhd1E9PZ36 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkhd1E9PZ36 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkhd1E9PZ36 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkhd1E9PZ36 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkhd1E9PZ36 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkhd1E9PZ36 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkhd1E9PZ36 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkhd1E9PZ36 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkhd1E9PZ36 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkhd1E9PZ36 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkhd1E9PZ36 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkhd1E9PZ36 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkhd1E9PZ36 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkhd1E9PZ36 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkhd1E9PZ36 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkhd1E9PZ36 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkhd1E9PZ36 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkhd1E9PZ36 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkhd1E9PZ36 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkhd1E9PZ36 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkhd1E9PZ36 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkhd1E9PZ36 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkhd1E9PZ36 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkhd1E9PZ36 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkhd1E9PZ36 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkhd1E9PZ36 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkhd1E9PZ36 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pkhd1E9PZ36 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pkhd1E9PZ36 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkhd1E9PZ36 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkhd1E9PZ36 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkhd1E9PZ36 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkhd1E9PZ36 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkhd1E9PZ36 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkhd1E9PZ36 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkhd1E9PZ36 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkhd1E9PZ36 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkhd1E9PZ36 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkhd1E9PZ36 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkhd1E9PZ36 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkhd1E9PZ36 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkhd1E9PZ36 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkhd1E9PZ36 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkhd1E9PZ36 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkhd1E9PZ36 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkhd1E9PZ36 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkhd1E9PZ36 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms