Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ13

Gm10608, Predicted gene 10608, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10608E9PZ13 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm10608E9PZ13 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm10608E9PZ13 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm10608E9PZ13 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm10608E9PZ13 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm10608E9PZ13 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm10608E9PZ13 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm10608E9PZ13 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm10608E9PZ13 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm10608E9PZ13 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm10608E9PZ13 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm10608E9PZ13 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm10608E9PZ13 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm10608E9PZ13 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm10608E9PZ13 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm10608E9PZ13 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm10608E9PZ13 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm10608E9PZ13 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm10608E9PZ13 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm10608E9PZ13 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm10608E9PZ13 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm10608E9PZ13 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm10608E9PZ13 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm10608E9PZ13 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm10608E9PZ13 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm10608E9PZ13 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm10608E9PZ13 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm10608E9PZ13 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm10608E9PZ13 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm10608E9PZ13 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm10608E9PZ13 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm10608E9PZ13 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm10608E9PZ13 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm10608E9PZ13 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm10608E9PZ13 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm10608E9PZ13 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm10608E9PZ13 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm10608E9PZ13 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm10608E9PZ13 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm10608E9PZ13 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm10608E9PZ13 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm10608E9PZ13 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm10608E9PZ13 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm10608E9PZ13 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm10608E9PZ13 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm10608E9PZ13 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm10608E9PZ13 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm10608E9PZ13 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm10608E9PZ13 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm10608E9PZ13 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm10608E9PZ13 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm10608E9PZ13 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm10608E9PZ13 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm10608E9PZ13 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm10608E9PZ13 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm10608E9PZ13 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm10608E9PZ13 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm10608E9PZ13 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm10608E9PZ13 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm10608E9PZ13 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm10608E9PZ13 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm10608E9PZ13 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm10608E9PZ13 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm10608E9PZ13 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm10608E9PZ13 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm10608E9PZ13 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm10608E9PZ13 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm10608E9PZ13 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm10608E9PZ13 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm10608E9PZ13 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm10608E9PZ13 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm10608E9PZ13 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm10608E9PZ13 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm10608E9PZ13 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm10608E9PZ13 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm10608E9PZ13 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm10608E9PZ13 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm10608E9PZ13 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm10608E9PZ13 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm10608E9PZ13 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm10608E9PZ13 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm10608E9PZ13 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm10608E9PZ13 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm10608E9PZ13 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm10608E9PZ13 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm10608E9PZ13 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm10608E9PZ13 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm10608E9PZ13 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm10608E9PZ13 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm10608E9PZ13 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm10608E9PZ13 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm10608E9PZ13 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm10608E9PZ13 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm10608E9PZ13 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm10608E9PZ13 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm10608E9PZ13 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm10608E9PZ13 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm10608E9PZ13 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm10608E9PZ13 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm10608E9PZ13 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms