Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
Rsf1E9PWW9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC42.51■■■■■ 4.4
Rsf1E9PWW9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
Rsf1E9PWW9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC42.49■■■■■ 4.39
Rsf1E9PWW9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC42.47■■■■■ 4.39
Rsf1E9PWW9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC42.47■■■■■ 4.39
Rsf1E9PWW9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
Rsf1E9PWW9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
Rsf1E9PWW9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC42.42■■■■■ 4.38
Rsf1E9PWW9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
Rsf1E9PWW9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
Rsf1E9PWW9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.39■■■■■ 4.38
Rsf1E9PWW9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
Rsf1E9PWW9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.38
Rsf1E9PWW9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC42.37■■■■■ 4.37
Rsf1E9PWW9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
Rsf1E9PWW9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC42.33■■■■■ 4.37
Rsf1E9PWW9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
Rsf1E9PWW9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC42.32■■■■■ 4.37
Rsf1E9PWW9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
Rsf1E9PWW9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
Rsf1E9PWW9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
Rsf1E9PWW9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
Rsf1E9PWW9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
Rsf1E9PWW9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Rsf1E9PWW9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Rsf1E9PWW9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Rsf1E9PWW9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Rsf1E9PWW9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
Rsf1E9PWW9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC42.21■■■■■ 4.35
Rsf1E9PWW9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Rsf1E9PWW9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
Rsf1E9PWW9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
Rsf1E9PWW9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Rsf1E9PWW9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Rsf1E9PWW9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Rsf1E9PWW9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC42.13■■■■■ 4.34
Rsf1E9PWW9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Rsf1E9PWW9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
Rsf1E9PWW9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC42.09■■■■■ 4.33
Rsf1E9PWW9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC42.07■■■■■ 4.33
Rsf1E9PWW9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
Rsf1E9PWW9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC42.06■■■■■ 4.32
Rsf1E9PWW9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Rsf1E9PWW9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC42.03■■■■■ 4.32
Rsf1E9PWW9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Rsf1E9PWW9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
Rsf1E9PWW9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
Rsf1E9PWW9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Rsf1E9PWW9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Rsf1E9PWW9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Rsf1E9PWW9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
Rsf1E9PWW9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
Rsf1E9PWW9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
Rsf1E9PWW9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC41.94■■■■■ 4.3
Rsf1E9PWW9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC41.93■■■■■ 4.3
Rsf1E9PWW9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Rsf1E9PWW9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC41.91■■■■■ 4.3
Rsf1E9PWW9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
Rsf1E9PWW9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
Rsf1E9PWW9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC41.9■■■■■ 4.3
Rsf1E9PWW9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
Rsf1E9PWW9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
Rsf1E9PWW9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC41.89■■■■■ 4.3
Rsf1E9PWW9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
Rsf1E9PWW9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
Rsf1E9PWW9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
Rsf1E9PWW9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
Rsf1E9PWW9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
Rsf1E9PWW9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC41.84■■■■■ 4.29
Rsf1E9PWW9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
Rsf1E9PWW9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC41.83■■■■■ 4.29
Rsf1E9PWW9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
Rsf1E9PWW9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC41.8■■■■■ 4.28
Rsf1E9PWW9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
Rsf1E9PWW9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.79■■■■■ 4.28
Rsf1E9PWW9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Rsf1E9PWW9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Rsf1E9PWW9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Rsf1E9PWW9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
Rsf1E9PWW9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Rsf1E9PWW9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Rsf1E9PWW9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
Rsf1E9PWW9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.73■■■■■ 4.27
Rsf1E9PWW9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
Rsf1E9PWW9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
Rsf1E9PWW9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
Rsf1E9PWW9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
Rsf1E9PWW9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
Rsf1E9PWW9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
Rsf1E9PWW9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
Rsf1E9PWW9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
Rsf1E9PWW9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
Rsf1E9PWW9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
Rsf1E9PWW9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
Rsf1E9PWW9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
Rsf1E9PWW9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
Rsf1E9PWW9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Rsf1E9PWW9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
Rsf1E9PWW9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms