Protein–RNA interactions for Protein: E9PWL0

Trim30d, Tripartite motif-containing 30D, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30dE9PWL0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Trim30dE9PWL0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Trim30dE9PWL0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Trim30dE9PWL0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Trim30dE9PWL0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Trim30dE9PWL0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Trim30dE9PWL0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Trim30dE9PWL0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Trim30dE9PWL0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Trim30dE9PWL0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Trim30dE9PWL0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Trim30dE9PWL0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Trim30dE9PWL0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Trim30dE9PWL0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Trim30dE9PWL0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Trim30dE9PWL0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Trim30dE9PWL0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Trim30dE9PWL0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Trim30dE9PWL0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Trim30dE9PWL0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Trim30dE9PWL0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Trim30dE9PWL0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Trim30dE9PWL0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Trim30dE9PWL0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Trim30dE9PWL0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trim30dE9PWL0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trim30dE9PWL0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Trim30dE9PWL0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Trim30dE9PWL0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Trim30dE9PWL0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Trim30dE9PWL0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Trim30dE9PWL0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Trim30dE9PWL0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Trim30dE9PWL0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trim30dE9PWL0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Trim30dE9PWL0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trim30dE9PWL0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Trim30dE9PWL0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trim30dE9PWL0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Trim30dE9PWL0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trim30dE9PWL0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Trim30dE9PWL0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Trim30dE9PWL0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Trim30dE9PWL0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Trim30dE9PWL0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Trim30dE9PWL0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Trim30dE9PWL0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trim30dE9PWL0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trim30dE9PWL0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trim30dE9PWL0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Trim30dE9PWL0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Trim30dE9PWL0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Trim30dE9PWL0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Trim30dE9PWL0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Trim30dE9PWL0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Trim30dE9PWL0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Trim30dE9PWL0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Trim30dE9PWL0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Trim30dE9PWL0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Trim30dE9PWL0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Trim30dE9PWL0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Trim30dE9PWL0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Trim30dE9PWL0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Trim30dE9PWL0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Trim30dE9PWL0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Trim30dE9PWL0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Trim30dE9PWL0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Trim30dE9PWL0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Trim30dE9PWL0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Trim30dE9PWL0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Trim30dE9PWL0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Trim30dE9PWL0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Trim30dE9PWL0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Trim30dE9PWL0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Trim30dE9PWL0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Trim30dE9PWL0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Trim30dE9PWL0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Trim30dE9PWL0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Trim30dE9PWL0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Trim30dE9PWL0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Trim30dE9PWL0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Trim30dE9PWL0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Trim30dE9PWL0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Trim30dE9PWL0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Trim30dE9PWL0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Trim30dE9PWL0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Trim30dE9PWL0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Trim30dE9PWL0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Trim30dE9PWL0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Trim30dE9PWL0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trim30dE9PWL0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trim30dE9PWL0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trim30dE9PWL0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Trim30dE9PWL0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Trim30dE9PWL0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Trim30dE9PWL0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Trim30dE9PWL0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trim30dE9PWL0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Trim30dE9PWL0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trim30dE9PWL0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms