Protein–RNA interactions for Protein: E9PVJ0

Gm2956, Predicted gene 2956, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2956E9PVJ0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm2956E9PVJ0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm2956E9PVJ0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm2956E9PVJ0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm2956E9PVJ0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm2956E9PVJ0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm2956E9PVJ0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm2956E9PVJ0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm2956E9PVJ0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm2956E9PVJ0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm2956E9PVJ0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm2956E9PVJ0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm2956E9PVJ0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm2956E9PVJ0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm2956E9PVJ0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm2956E9PVJ0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm2956E9PVJ0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm2956E9PVJ0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm2956E9PVJ0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm2956E9PVJ0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm2956E9PVJ0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm2956E9PVJ0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm2956E9PVJ0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm2956E9PVJ0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm2956E9PVJ0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm2956E9PVJ0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm2956E9PVJ0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm2956E9PVJ0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm2956E9PVJ0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm2956E9PVJ0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm2956E9PVJ0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm2956E9PVJ0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm2956E9PVJ0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm2956E9PVJ0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm2956E9PVJ0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm2956E9PVJ0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm2956E9PVJ0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm2956E9PVJ0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm2956E9PVJ0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm2956E9PVJ0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm2956E9PVJ0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm2956E9PVJ0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm2956E9PVJ0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm2956E9PVJ0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm2956E9PVJ0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm2956E9PVJ0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm2956E9PVJ0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm2956E9PVJ0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm2956E9PVJ0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gm2956E9PVJ0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm2956E9PVJ0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm2956E9PVJ0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm2956E9PVJ0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm2956E9PVJ0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm2956E9PVJ0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm2956E9PVJ0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm2956E9PVJ0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm2956E9PVJ0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm2956E9PVJ0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm2956E9PVJ0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm2956E9PVJ0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm2956E9PVJ0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm2956E9PVJ0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm2956E9PVJ0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm2956E9PVJ0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm2956E9PVJ0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm2956E9PVJ0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm2956E9PVJ0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm2956E9PVJ0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm2956E9PVJ0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm2956E9PVJ0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm2956E9PVJ0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm2956E9PVJ0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm2956E9PVJ0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm2956E9PVJ0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm2956E9PVJ0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm2956E9PVJ0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm2956E9PVJ0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm2956E9PVJ0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm2956E9PVJ0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm2956E9PVJ0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm2956E9PVJ0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm2956E9PVJ0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm2956E9PVJ0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm2956E9PVJ0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm2956E9PVJ0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm2956E9PVJ0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm2956E9PVJ0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm2956E9PVJ0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm2956E9PVJ0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm2956E9PVJ0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm2956E9PVJ0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm2956E9PVJ0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm2956E9PVJ0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm2956E9PVJ0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm2956E9PVJ0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm2956E9PVJ0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm2956E9PVJ0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm2956E9PVJ0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm2956E9PVJ0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms