Protein–RNA interactions for Protein: D4PHA7

Wscd2, WSC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wscd2D4PHA7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wscd2D4PHA7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wscd2D4PHA7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wscd2D4PHA7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Wscd2D4PHA7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wscd2D4PHA7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wscd2D4PHA7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wscd2D4PHA7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wscd2D4PHA7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wscd2D4PHA7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wscd2D4PHA7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Wscd2D4PHA7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Wscd2D4PHA7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Wscd2D4PHA7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Wscd2D4PHA7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Wscd2D4PHA7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Wscd2D4PHA7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Wscd2D4PHA7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Wscd2D4PHA7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Wscd2D4PHA7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Wscd2D4PHA7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wscd2D4PHA7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Wscd2D4PHA7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Wscd2D4PHA7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Wscd2D4PHA7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Wscd2D4PHA7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Wscd2D4PHA7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Wscd2D4PHA7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Wscd2D4PHA7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Wscd2D4PHA7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Wscd2D4PHA7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Wscd2D4PHA7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Wscd2D4PHA7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Wscd2D4PHA7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Wscd2D4PHA7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Wscd2D4PHA7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Wscd2D4PHA7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Wscd2D4PHA7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wscd2D4PHA7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wscd2D4PHA7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Wscd2D4PHA7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wscd2D4PHA7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wscd2D4PHA7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wscd2D4PHA7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wscd2D4PHA7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wscd2D4PHA7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wscd2D4PHA7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Wscd2D4PHA7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Wscd2D4PHA7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Wscd2D4PHA7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wscd2D4PHA7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Wscd2D4PHA7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Wscd2D4PHA7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Wscd2D4PHA7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Wscd2D4PHA7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Wscd2D4PHA7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Wscd2D4PHA7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Wscd2D4PHA7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Wscd2D4PHA7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Wscd2D4PHA7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Wscd2D4PHA7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Wscd2D4PHA7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Wscd2D4PHA7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Wscd2D4PHA7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Wscd2D4PHA7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Wscd2D4PHA7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Wscd2D4PHA7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Wscd2D4PHA7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Wscd2D4PHA7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Wscd2D4PHA7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Wscd2D4PHA7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Wscd2D4PHA7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Wscd2D4PHA7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wscd2D4PHA7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wscd2D4PHA7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wscd2D4PHA7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Wscd2D4PHA7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wscd2D4PHA7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Wscd2D4PHA7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Wscd2D4PHA7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Wscd2D4PHA7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Wscd2D4PHA7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Wscd2D4PHA7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Wscd2D4PHA7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Wscd2D4PHA7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Wscd2D4PHA7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Wscd2D4PHA7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Wscd2D4PHA7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Wscd2D4PHA7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Wscd2D4PHA7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Wscd2D4PHA7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Wscd2D4PHA7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Wscd2D4PHA7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Wscd2D4PHA7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Wscd2D4PHA7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Wscd2D4PHA7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Wscd2D4PHA7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Wscd2D4PHA7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Wscd2D4PHA7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Wscd2D4PHA7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms