Protein–RNA interactions for Protein: D3Z622

4930455H04Rik, MCG1045678, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930455H04RikD3Z622 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930455H04RikD3Z622 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930455H04RikD3Z622 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930455H04RikD3Z622 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930455H04RikD3Z622 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930455H04RikD3Z622 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
4930455H04RikD3Z622 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
4930455H04RikD3Z622 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4930455H04RikD3Z622 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4930455H04RikD3Z622 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4930455H04RikD3Z622 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4930455H04RikD3Z622 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4930455H04RikD3Z622 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930455H04RikD3Z622 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930455H04RikD3Z622 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
4930455H04RikD3Z622 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
4930455H04RikD3Z622 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
4930455H04RikD3Z622 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4930455H04RikD3Z622 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
4930455H04RikD3Z622 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
4930455H04RikD3Z622 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
4930455H04RikD3Z622 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
4930455H04RikD3Z622 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
4930455H04RikD3Z622 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
4930455H04RikD3Z622 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
4930455H04RikD3Z622 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
4930455H04RikD3Z622 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
4930455H04RikD3Z622 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
4930455H04RikD3Z622 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
4930455H04RikD3Z622 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
4930455H04RikD3Z622 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
4930455H04RikD3Z622 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
4930455H04RikD3Z622 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
4930455H04RikD3Z622 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
4930455H04RikD3Z622 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
4930455H04RikD3Z622 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
4930455H04RikD3Z622 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
4930455H04RikD3Z622 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
4930455H04RikD3Z622 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
4930455H04RikD3Z622 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
4930455H04RikD3Z622 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4930455H04RikD3Z622 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4930455H04RikD3Z622 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
4930455H04RikD3Z622 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
4930455H04RikD3Z622 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4930455H04RikD3Z622 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4930455H04RikD3Z622 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4930455H04RikD3Z622 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4930455H04RikD3Z622 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
4930455H04RikD3Z622 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
4930455H04RikD3Z622 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
4930455H04RikD3Z622 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
4930455H04RikD3Z622 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4930455H04RikD3Z622 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4930455H04RikD3Z622 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
4930455H04RikD3Z622 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
4930455H04RikD3Z622 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
4930455H04RikD3Z622 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
4930455H04RikD3Z622 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
4930455H04RikD3Z622 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
4930455H04RikD3Z622 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
4930455H04RikD3Z622 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
4930455H04RikD3Z622 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4930455H04RikD3Z622 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
4930455H04RikD3Z622 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4930455H04RikD3Z622 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
4930455H04RikD3Z622 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4930455H04RikD3Z622 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930455H04RikD3Z622 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930455H04RikD3Z622 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930455H04RikD3Z622 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4930455H04RikD3Z622 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
4930455H04RikD3Z622 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
4930455H04RikD3Z622 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4930455H04RikD3Z622 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4930455H04RikD3Z622 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
4930455H04RikD3Z622 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
4930455H04RikD3Z622 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4930455H04RikD3Z622 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4930455H04RikD3Z622 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930455H04RikD3Z622 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930455H04RikD3Z622 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930455H04RikD3Z622 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930455H04RikD3Z622 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930455H04RikD3Z622 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930455H04RikD3Z622 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4930455H04RikD3Z622 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
4930455H04RikD3Z622 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4930455H04RikD3Z622 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4930455H04RikD3Z622 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4930455H04RikD3Z622 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930455H04RikD3Z622 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930455H04RikD3Z622 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930455H04RikD3Z622 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930455H04RikD3Z622 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930455H04RikD3Z622 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930455H04RikD3Z622 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930455H04RikD3Z622 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930455H04RikD3Z622 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930455H04RikD3Z622 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms