Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5M2

Gm10110, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10110D3Z5M2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm10110D3Z5M2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm10110D3Z5M2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm10110D3Z5M2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm10110D3Z5M2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gm10110D3Z5M2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gm10110D3Z5M2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm10110D3Z5M2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm10110D3Z5M2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm10110D3Z5M2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm10110D3Z5M2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm10110D3Z5M2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm10110D3Z5M2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm10110D3Z5M2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gm10110D3Z5M2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gm10110D3Z5M2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm10110D3Z5M2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm10110D3Z5M2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm10110D3Z5M2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm10110D3Z5M2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm10110D3Z5M2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm10110D3Z5M2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm10110D3Z5M2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm10110D3Z5M2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm10110D3Z5M2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm10110D3Z5M2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm10110D3Z5M2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Gm10110D3Z5M2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm10110D3Z5M2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm10110D3Z5M2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm10110D3Z5M2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm10110D3Z5M2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gm10110D3Z5M2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm10110D3Z5M2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm10110D3Z5M2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm10110D3Z5M2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm10110D3Z5M2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm10110D3Z5M2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm10110D3Z5M2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm10110D3Z5M2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm10110D3Z5M2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm10110D3Z5M2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm10110D3Z5M2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm10110D3Z5M2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm10110D3Z5M2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm10110D3Z5M2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm10110D3Z5M2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm10110D3Z5M2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm10110D3Z5M2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm10110D3Z5M2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm10110D3Z5M2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm10110D3Z5M2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm10110D3Z5M2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm10110D3Z5M2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm10110D3Z5M2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gm10110D3Z5M2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm10110D3Z5M2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm10110D3Z5M2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm10110D3Z5M2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm10110D3Z5M2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm10110D3Z5M2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm10110D3Z5M2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm10110D3Z5M2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm10110D3Z5M2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm10110D3Z5M2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gm10110D3Z5M2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm10110D3Z5M2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm10110D3Z5M2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gm10110D3Z5M2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gm10110D3Z5M2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gm10110D3Z5M2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gm10110D3Z5M2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gm10110D3Z5M2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gm10110D3Z5M2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm10110D3Z5M2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm10110D3Z5M2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm10110D3Z5M2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm10110D3Z5M2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm10110D3Z5M2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm10110D3Z5M2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm10110D3Z5M2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm10110D3Z5M2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm10110D3Z5M2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm10110D3Z5M2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm10110D3Z5M2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm10110D3Z5M2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm10110D3Z5M2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm10110D3Z5M2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm10110D3Z5M2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm10110D3Z5M2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm10110D3Z5M2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm10110D3Z5M2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm10110D3Z5M2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm10110D3Z5M2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm10110D3Z5M2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm10110D3Z5M2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm10110D3Z5M2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm10110D3Z5M2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gm10110D3Z5M2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gm10110D3Z5M2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms