Protein–RNA interactions for Protein: D3Z460

Gm1330, Predicted gene 1330, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1330D3Z460 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm1330D3Z460 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm1330D3Z460 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm1330D3Z460 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm1330D3Z460 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm1330D3Z460 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm1330D3Z460 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm1330D3Z460 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm1330D3Z460 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm1330D3Z460 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm1330D3Z460 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm1330D3Z460 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm1330D3Z460 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm1330D3Z460 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm1330D3Z460 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm1330D3Z460 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm1330D3Z460 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm1330D3Z460 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm1330D3Z460 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm1330D3Z460 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm1330D3Z460 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm1330D3Z460 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm1330D3Z460 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm1330D3Z460 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm1330D3Z460 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm1330D3Z460 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm1330D3Z460 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm1330D3Z460 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm1330D3Z460 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm1330D3Z460 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm1330D3Z460 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm1330D3Z460 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm1330D3Z460 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm1330D3Z460 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm1330D3Z460 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm1330D3Z460 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm1330D3Z460 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm1330D3Z460 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm1330D3Z460 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm1330D3Z460 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm1330D3Z460 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm1330D3Z460 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm1330D3Z460 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm1330D3Z460 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm1330D3Z460 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm1330D3Z460 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm1330D3Z460 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm1330D3Z460 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm1330D3Z460 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm1330D3Z460 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm1330D3Z460 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm1330D3Z460 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm1330D3Z460 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm1330D3Z460 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm1330D3Z460 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm1330D3Z460 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm1330D3Z460 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm1330D3Z460 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm1330D3Z460 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm1330D3Z460 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm1330D3Z460 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm1330D3Z460 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm1330D3Z460 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm1330D3Z460 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm1330D3Z460 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm1330D3Z460 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm1330D3Z460 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm1330D3Z460 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm1330D3Z460 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm1330D3Z460 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm1330D3Z460 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm1330D3Z460 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm1330D3Z460 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm1330D3Z460 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm1330D3Z460 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm1330D3Z460 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm1330D3Z460 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm1330D3Z460 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm1330D3Z460 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm1330D3Z460 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm1330D3Z460 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm1330D3Z460 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm1330D3Z460 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm1330D3Z460 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm1330D3Z460 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm1330D3Z460 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm1330D3Z460 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm1330D3Z460 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm1330D3Z460 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm1330D3Z460 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm1330D3Z460 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm1330D3Z460 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm1330D3Z460 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm1330D3Z460 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm1330D3Z460 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm1330D3Z460 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm1330D3Z460 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm1330D3Z460 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm1330D3Z460 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm1330D3Z460 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms