Protein–RNA interactions for Protein: D3Z291

Calhm1, Calcium homeostasis modulator protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm1D3Z291 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Calhm1D3Z291 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Calhm1D3Z291 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Calhm1D3Z291 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Calhm1D3Z291 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Calhm1D3Z291 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Calhm1D3Z291 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Calhm1D3Z291 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Calhm1D3Z291 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calhm1D3Z291 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calhm1D3Z291 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calhm1D3Z291 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calhm1D3Z291 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Calhm1D3Z291 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Calhm1D3Z291 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Calhm1D3Z291 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Calhm1D3Z291 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Calhm1D3Z291 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Calhm1D3Z291 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Calhm1D3Z291 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Calhm1D3Z291 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calhm1D3Z291 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calhm1D3Z291 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calhm1D3Z291 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Calhm1D3Z291 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calhm1D3Z291 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calhm1D3Z291 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calhm1D3Z291 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Calhm1D3Z291 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Calhm1D3Z291 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Calhm1D3Z291 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Calhm1D3Z291 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Calhm1D3Z291 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Calhm1D3Z291 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Calhm1D3Z291 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Calhm1D3Z291 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Calhm1D3Z291 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Calhm1D3Z291 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Calhm1D3Z291 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Calhm1D3Z291 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Calhm1D3Z291 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Calhm1D3Z291 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Calhm1D3Z291 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Calhm1D3Z291 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Calhm1D3Z291 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Calhm1D3Z291 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Calhm1D3Z291 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Calhm1D3Z291 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Calhm1D3Z291 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Calhm1D3Z291 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Calhm1D3Z291 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Calhm1D3Z291 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Calhm1D3Z291 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Calhm1D3Z291 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Calhm1D3Z291 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Calhm1D3Z291 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Calhm1D3Z291 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Calhm1D3Z291 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Calhm1D3Z291 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Calhm1D3Z291 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Calhm1D3Z291 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Calhm1D3Z291 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Calhm1D3Z291 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Calhm1D3Z291 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Calhm1D3Z291 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Calhm1D3Z291 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Calhm1D3Z291 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Calhm1D3Z291 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Calhm1D3Z291 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Calhm1D3Z291 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Calhm1D3Z291 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Calhm1D3Z291 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calhm1D3Z291 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calhm1D3Z291 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Calhm1D3Z291 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calhm1D3Z291 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calhm1D3Z291 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calhm1D3Z291 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Calhm1D3Z291 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Calhm1D3Z291 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Calhm1D3Z291 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Calhm1D3Z291 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Calhm1D3Z291 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calhm1D3Z291 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calhm1D3Z291 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calhm1D3Z291 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calhm1D3Z291 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calhm1D3Z291 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Calhm1D3Z291 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calhm1D3Z291 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Calhm1D3Z291 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Calhm1D3Z291 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Calhm1D3Z291 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Calhm1D3Z291 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Calhm1D3Z291 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Calhm1D3Z291 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Calhm1D3Z291 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Calhm1D3Z291 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Calhm1D3Z291 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Calhm1D3Z291 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms