Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3543D3Z235 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3543D3Z235 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3543D3Z235 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3543D3Z235 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3543D3Z235 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3543D3Z235 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3543D3Z235 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm3543D3Z235 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3543D3Z235 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3543D3Z235 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3543D3Z235 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3543D3Z235 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3543D3Z235 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3543D3Z235 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3543D3Z235 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3543D3Z235 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3543D3Z235 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3543D3Z235 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3543D3Z235 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3543D3Z235 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3543D3Z235 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3543D3Z235 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3543D3Z235 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3543D3Z235 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3543D3Z235 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3543D3Z235 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3543D3Z235 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3543D3Z235 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3543D3Z235 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3543D3Z235 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3543D3Z235 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3543D3Z235 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3543D3Z235 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3543D3Z235 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3543D3Z235 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3543D3Z235 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm3543D3Z235 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm3543D3Z235 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm3543D3Z235 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3543D3Z235 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3543D3Z235 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3543D3Z235 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3543D3Z235 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3543D3Z235 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3543D3Z235 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3543D3Z235 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3543D3Z235 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3543D3Z235 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3543D3Z235 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3543D3Z235 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3543D3Z235 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3543D3Z235 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3543D3Z235 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3543D3Z235 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3543D3Z235 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3543D3Z235 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3543D3Z235 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm3543D3Z235 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3543D3Z235 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3543D3Z235 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3543D3Z235 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3543D3Z235 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3543D3Z235 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3543D3Z235 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3543D3Z235 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3543D3Z235 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3543D3Z235 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3543D3Z235 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3543D3Z235 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3543D3Z235 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3543D3Z235 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3543D3Z235 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3543D3Z235 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3543D3Z235 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3543D3Z235 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3543D3Z235 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3543D3Z235 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3543D3Z235 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms