Protein–RNA interactions for Protein: D3YYZ1

Ldlrad1, Low density lipoprotein receptor class A domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad1D3YYZ1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ldlrad1D3YYZ1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ldlrad1D3YYZ1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ldlrad1D3YYZ1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ldlrad1D3YYZ1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ldlrad1D3YYZ1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ldlrad1D3YYZ1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ldlrad1D3YYZ1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ldlrad1D3YYZ1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ldlrad1D3YYZ1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ldlrad1D3YYZ1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ldlrad1D3YYZ1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ldlrad1D3YYZ1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ldlrad1D3YYZ1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ldlrad1D3YYZ1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ldlrad1D3YYZ1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ldlrad1D3YYZ1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ldlrad1D3YYZ1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ldlrad1D3YYZ1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ldlrad1D3YYZ1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ldlrad1D3YYZ1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ldlrad1D3YYZ1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ldlrad1D3YYZ1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ldlrad1D3YYZ1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Ldlrad1D3YYZ1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ldlrad1D3YYZ1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ldlrad1D3YYZ1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Ldlrad1D3YYZ1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ldlrad1D3YYZ1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ldlrad1D3YYZ1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ldlrad1D3YYZ1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ldlrad1D3YYZ1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ldlrad1D3YYZ1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ldlrad1D3YYZ1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ldlrad1D3YYZ1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ldlrad1D3YYZ1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Ldlrad1D3YYZ1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ldlrad1D3YYZ1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ldlrad1D3YYZ1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ldlrad1D3YYZ1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ldlrad1D3YYZ1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ldlrad1D3YYZ1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ldlrad1D3YYZ1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ldlrad1D3YYZ1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ldlrad1D3YYZ1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ldlrad1D3YYZ1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ldlrad1D3YYZ1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ldlrad1D3YYZ1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ldlrad1D3YYZ1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ldlrad1D3YYZ1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ldlrad1D3YYZ1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ldlrad1D3YYZ1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ldlrad1D3YYZ1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ldlrad1D3YYZ1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ldlrad1D3YYZ1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Ldlrad1D3YYZ1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ldlrad1D3YYZ1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ldlrad1D3YYZ1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ldlrad1D3YYZ1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ldlrad1D3YYZ1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ldlrad1D3YYZ1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ldlrad1D3YYZ1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ldlrad1D3YYZ1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ldlrad1D3YYZ1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ldlrad1D3YYZ1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ldlrad1D3YYZ1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ldlrad1D3YYZ1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ldlrad1D3YYZ1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ldlrad1D3YYZ1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Ldlrad1D3YYZ1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Ldlrad1D3YYZ1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ldlrad1D3YYZ1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ldlrad1D3YYZ1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ldlrad1D3YYZ1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ldlrad1D3YYZ1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ldlrad1D3YYZ1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ldlrad1D3YYZ1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ldlrad1D3YYZ1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ldlrad1D3YYZ1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ldlrad1D3YYZ1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ldlrad1D3YYZ1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ldlrad1D3YYZ1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ldlrad1D3YYZ1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ldlrad1D3YYZ1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ldlrad1D3YYZ1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ldlrad1D3YYZ1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ldlrad1D3YYZ1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ldlrad1D3YYZ1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ldlrad1D3YYZ1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ldlrad1D3YYZ1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
Ldlrad1D3YYZ1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ldlrad1D3YYZ1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ldlrad1D3YYZ1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ldlrad1D3YYZ1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ldlrad1D3YYZ1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ldlrad1D3YYZ1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ldlrad1D3YYZ1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms