Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf217D3YYI7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf217D3YYI7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf217D3YYI7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf217D3YYI7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf217D3YYI7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf217D3YYI7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf217D3YYI7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf217D3YYI7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf217D3YYI7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf217D3YYI7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf217D3YYI7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf217D3YYI7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf217D3YYI7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf217D3YYI7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf217D3YYI7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf217D3YYI7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf217D3YYI7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf217D3YYI7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf217D3YYI7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf217D3YYI7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf217D3YYI7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf217D3YYI7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rnf217D3YYI7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rnf217D3YYI7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf217D3YYI7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf217D3YYI7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf217D3YYI7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf217D3YYI7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf217D3YYI7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf217D3YYI7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf217D3YYI7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf217D3YYI7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf217D3YYI7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf217D3YYI7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf217D3YYI7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf217D3YYI7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf217D3YYI7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf217D3YYI7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rnf217D3YYI7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf217D3YYI7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf217D3YYI7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf217D3YYI7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf217D3YYI7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf217D3YYI7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf217D3YYI7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf217D3YYI7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf217D3YYI7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf217D3YYI7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf217D3YYI7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf217D3YYI7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf217D3YYI7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf217D3YYI7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf217D3YYI7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf217D3YYI7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rnf217D3YYI7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rnf217D3YYI7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf217D3YYI7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf217D3YYI7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf217D3YYI7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf217D3YYI7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf217D3YYI7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf217D3YYI7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf217D3YYI7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf217D3YYI7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf217D3YYI7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf217D3YYI7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf217D3YYI7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf217D3YYI7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf217D3YYI7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf217D3YYI7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf217D3YYI7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf217D3YYI7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf217D3YYI7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf217D3YYI7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf217D3YYI7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf217D3YYI7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf217D3YYI7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf217D3YYI7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf217D3YYI7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf217D3YYI7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf217D3YYI7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf217D3YYI7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf217D3YYI7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf217D3YYI7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf217D3YYI7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf217D3YYI7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf217D3YYI7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf217D3YYI7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf217D3YYI7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf217D3YYI7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf217D3YYI7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf217D3YYI7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf217D3YYI7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf217D3YYI7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf217D3YYI7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf217D3YYI7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf217D3YYI7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf217D3YYI7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf217D3YYI7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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