Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK8

1700015F17Rik, RIKEN cDNA 1700015F17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700015F17RikD3YUK8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700015F17RikD3YUK8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700015F17RikD3YUK8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700015F17RikD3YUK8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700015F17RikD3YUK8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700015F17RikD3YUK8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700015F17RikD3YUK8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700015F17RikD3YUK8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700015F17RikD3YUK8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700015F17RikD3YUK8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700015F17RikD3YUK8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
1700015F17RikD3YUK8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
1700015F17RikD3YUK8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
1700015F17RikD3YUK8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700015F17RikD3YUK8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700015F17RikD3YUK8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700015F17RikD3YUK8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700015F17RikD3YUK8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700015F17RikD3YUK8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700015F17RikD3YUK8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700015F17RikD3YUK8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700015F17RikD3YUK8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700015F17RikD3YUK8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700015F17RikD3YUK8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700015F17RikD3YUK8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700015F17RikD3YUK8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700015F17RikD3YUK8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700015F17RikD3YUK8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700015F17RikD3YUK8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700015F17RikD3YUK8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700015F17RikD3YUK8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700015F17RikD3YUK8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700015F17RikD3YUK8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700015F17RikD3YUK8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700015F17RikD3YUK8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700015F17RikD3YUK8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700015F17RikD3YUK8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700015F17RikD3YUK8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700015F17RikD3YUK8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700015F17RikD3YUK8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700015F17RikD3YUK8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700015F17RikD3YUK8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700015F17RikD3YUK8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
1700015F17RikD3YUK8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700015F17RikD3YUK8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700015F17RikD3YUK8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700015F17RikD3YUK8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700015F17RikD3YUK8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700015F17RikD3YUK8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700015F17RikD3YUK8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700015F17RikD3YUK8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700015F17RikD3YUK8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700015F17RikD3YUK8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700015F17RikD3YUK8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
1700015F17RikD3YUK8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
1700015F17RikD3YUK8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
1700015F17RikD3YUK8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700015F17RikD3YUK8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700015F17RikD3YUK8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700015F17RikD3YUK8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700015F17RikD3YUK8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700015F17RikD3YUK8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700015F17RikD3YUK8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700015F17RikD3YUK8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700015F17RikD3YUK8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700015F17RikD3YUK8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700015F17RikD3YUK8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700015F17RikD3YUK8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700015F17RikD3YUK8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700015F17RikD3YUK8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700015F17RikD3YUK8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
1700015F17RikD3YUK8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700015F17RikD3YUK8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700015F17RikD3YUK8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700015F17RikD3YUK8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700015F17RikD3YUK8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700015F17RikD3YUK8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700015F17RikD3YUK8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700015F17RikD3YUK8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700015F17RikD3YUK8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700015F17RikD3YUK8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700015F17RikD3YUK8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700015F17RikD3YUK8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700015F17RikD3YUK8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700015F17RikD3YUK8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700015F17RikD3YUK8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
1700015F17RikD3YUK8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700015F17RikD3YUK8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700015F17RikD3YUK8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700015F17RikD3YUK8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700015F17RikD3YUK8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700015F17RikD3YUK8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700015F17RikD3YUK8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700015F17RikD3YUK8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
1700015F17RikD3YUK8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
1700015F17RikD3YUK8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700015F17RikD3YUK8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700015F17RikD3YUK8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700015F17RikD3YUK8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700015F17RikD3YUK8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms