Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cyp26c1B2RXA7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cyp26c1B2RXA7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Cyp26c1B2RXA7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cyp26c1B2RXA7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cyp26c1B2RXA7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cyp26c1B2RXA7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cyp26c1B2RXA7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cyp26c1B2RXA7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cyp26c1B2RXA7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cyp26c1B2RXA7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cyp26c1B2RXA7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cyp26c1B2RXA7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cyp26c1B2RXA7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cyp26c1B2RXA7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cyp26c1B2RXA7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cyp26c1B2RXA7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cyp26c1B2RXA7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cyp26c1B2RXA7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cyp26c1B2RXA7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cyp26c1B2RXA7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cyp26c1B2RXA7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Cyp26c1B2RXA7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cyp26c1B2RXA7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cyp26c1B2RXA7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cyp26c1B2RXA7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cyp26c1B2RXA7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cyp26c1B2RXA7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cyp26c1B2RXA7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cyp26c1B2RXA7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cyp26c1B2RXA7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cyp26c1B2RXA7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cyp26c1B2RXA7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Cyp26c1B2RXA7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cyp26c1B2RXA7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cyp26c1B2RXA7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cyp26c1B2RXA7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cyp26c1B2RXA7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cyp26c1B2RXA7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cyp26c1B2RXA7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cyp26c1B2RXA7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Cyp26c1B2RXA7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cyp26c1B2RXA7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cyp26c1B2RXA7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cyp26c1B2RXA7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cyp26c1B2RXA7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Cyp26c1B2RXA7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cyp26c1B2RXA7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cyp26c1B2RXA7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Cyp26c1B2RXA7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cyp26c1B2RXA7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cyp26c1B2RXA7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cyp26c1B2RXA7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cyp26c1B2RXA7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Cyp26c1B2RXA7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cyp26c1B2RXA7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cyp26c1B2RXA7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cyp26c1B2RXA7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cyp26c1B2RXA7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cyp26c1B2RXA7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cyp26c1B2RXA7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cyp26c1B2RXA7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cyp26c1B2RXA7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cyp26c1B2RXA7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cyp26c1B2RXA7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cyp26c1B2RXA7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cyp26c1B2RXA7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cyp26c1B2RXA7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cyp26c1B2RXA7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cyp26c1B2RXA7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cyp26c1B2RXA7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cyp26c1B2RXA7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cyp26c1B2RXA7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cyp26c1B2RXA7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cyp26c1B2RXA7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cyp26c1B2RXA7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cyp26c1B2RXA7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cyp26c1B2RXA7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cyp26c1B2RXA7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cyp26c1B2RXA7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cyp26c1B2RXA7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cyp26c1B2RXA7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cyp26c1B2RXA7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cyp26c1B2RXA7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cyp26c1B2RXA7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cyp26c1B2RXA7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cyp26c1B2RXA7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Cyp26c1B2RXA7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cyp26c1B2RXA7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cyp26c1B2RXA7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cyp26c1B2RXA7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cyp26c1B2RXA7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cyp26c1B2RXA7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cyp26c1B2RXA7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cyp26c1B2RXA7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cyp26c1B2RXA7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cyp26c1B2RXA7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cyp26c1B2RXA7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cyp26c1B2RXA7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cyp26c1B2RXA7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms