Protein–RNA interactions for Protein: B2RT41

Zfc3h1, Zinc finger, C3H1-type-containing, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,992 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfc3h1B2RT41 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zfc3h1B2RT41 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zfc3h1B2RT41 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zfc3h1B2RT41 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zfc3h1B2RT41 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zfc3h1B2RT41 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zfc3h1B2RT41 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zfc3h1B2RT41 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zfc3h1B2RT41 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zfc3h1B2RT41 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zfc3h1B2RT41 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Zfc3h1B2RT41 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Zfc3h1B2RT41 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zfc3h1B2RT41 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zfc3h1B2RT41 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zfc3h1B2RT41 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zfc3h1B2RT41 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zfc3h1B2RT41 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zfc3h1B2RT41 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Zfc3h1B2RT41 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfc3h1B2RT41 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfc3h1B2RT41 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zfc3h1B2RT41 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zfc3h1B2RT41 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zfc3h1B2RT41 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfc3h1B2RT41 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfc3h1B2RT41 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfc3h1B2RT41 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfc3h1B2RT41 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfc3h1B2RT41 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfc3h1B2RT41 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfc3h1B2RT41 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfc3h1B2RT41 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfc3h1B2RT41 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfc3h1B2RT41 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfc3h1B2RT41 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfc3h1B2RT41 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfc3h1B2RT41 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zfc3h1B2RT41 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfc3h1B2RT41 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfc3h1B2RT41 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Zfc3h1B2RT41 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfc3h1B2RT41 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfc3h1B2RT41 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfc3h1B2RT41 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfc3h1B2RT41 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfc3h1B2RT41 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfc3h1B2RT41 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfc3h1B2RT41 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfc3h1B2RT41 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfc3h1B2RT41 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfc3h1B2RT41 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfc3h1B2RT41 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfc3h1B2RT41 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfc3h1B2RT41 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfc3h1B2RT41 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfc3h1B2RT41 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfc3h1B2RT41 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfc3h1B2RT41 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfc3h1B2RT41 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfc3h1B2RT41 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfc3h1B2RT41 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfc3h1B2RT41 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zfc3h1B2RT41 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zfc3h1B2RT41 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zfc3h1B2RT41 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zfc3h1B2RT41 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zfc3h1B2RT41 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zfc3h1B2RT41 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zfc3h1B2RT41 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfc3h1B2RT41 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfc3h1B2RT41 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfc3h1B2RT41 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfc3h1B2RT41 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfc3h1B2RT41 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfc3h1B2RT41 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zfc3h1B2RT41 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zfc3h1B2RT41 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zfc3h1B2RT41 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zfc3h1B2RT41 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zfc3h1B2RT41 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zfc3h1B2RT41 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zfc3h1B2RT41 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zfc3h1B2RT41 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zfc3h1B2RT41 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zfc3h1B2RT41 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zfc3h1B2RT41 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Zfc3h1B2RT41 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zfc3h1B2RT41 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Zfc3h1B2RT41 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zfc3h1B2RT41 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zfc3h1B2RT41 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zfc3h1B2RT41 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfc3h1B2RT41 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfc3h1B2RT41 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfc3h1B2RT41 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfc3h1B2RT41 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfc3h1B2RT41 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfc3h1B2RT41 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfc3h1B2RT41 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms