Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rrn3B2RS91 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rrn3B2RS91 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rrn3B2RS91 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rrn3B2RS91 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rrn3B2RS91 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rrn3B2RS91 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rrn3B2RS91 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rrn3B2RS91 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rrn3B2RS91 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rrn3B2RS91 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rrn3B2RS91 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rrn3B2RS91 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rrn3B2RS91 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rrn3B2RS91 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rrn3B2RS91 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rrn3B2RS91 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rrn3B2RS91 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rrn3B2RS91 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rrn3B2RS91 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rrn3B2RS91 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rrn3B2RS91 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rrn3B2RS91 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rrn3B2RS91 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rrn3B2RS91 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrn3B2RS91 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrn3B2RS91 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrn3B2RS91 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrn3B2RS91 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rrn3B2RS91 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rrn3B2RS91 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rrn3B2RS91 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rrn3B2RS91 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rrn3B2RS91 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rrn3B2RS91 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rrn3B2RS91 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrn3B2RS91 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrn3B2RS91 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrn3B2RS91 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rrn3B2RS91 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rrn3B2RS91 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rrn3B2RS91 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rrn3B2RS91 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rrn3B2RS91 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrn3B2RS91 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rrn3B2RS91 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrn3B2RS91 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rrn3B2RS91 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrn3B2RS91 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrn3B2RS91 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrn3B2RS91 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrn3B2RS91 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrn3B2RS91 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rrn3B2RS91 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rrn3B2RS91 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rrn3B2RS91 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrn3B2RS91 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrn3B2RS91 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rrn3B2RS91 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rrn3B2RS91 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rrn3B2RS91 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rrn3B2RS91 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rrn3B2RS91 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rrn3B2RS91 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rrn3B2RS91 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rrn3B2RS91 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rrn3B2RS91 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rrn3B2RS91 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rrn3B2RS91 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rrn3B2RS91 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rrn3B2RS91 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rrn3B2RS91 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rrn3B2RS91 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rrn3B2RS91 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rrn3B2RS91 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rrn3B2RS91 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rrn3B2RS91 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rrn3B2RS91 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rrn3B2RS91 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rrn3B2RS91 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rrn3B2RS91 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rrn3B2RS91 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rrn3B2RS91 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rrn3B2RS91 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rrn3B2RS91 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rrn3B2RS91 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rrn3B2RS91 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rrn3B2RS91 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rrn3B2RS91 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rrn3B2RS91 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rrn3B2RS91 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rrn3B2RS91 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rrn3B2RS91 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrn3B2RS91 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrn3B2RS91 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrn3B2RS91 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrn3B2RS91 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrn3B2RS91 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rrn3B2RS91 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rrn3B2RS91 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
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