Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Brpf1B2RRD7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Brpf1B2RRD7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Brpf1B2RRD7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Brpf1B2RRD7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Brpf1B2RRD7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Brpf1B2RRD7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Brpf1B2RRD7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Brpf1B2RRD7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Brpf1B2RRD7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Brpf1B2RRD7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Brpf1B2RRD7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Brpf1B2RRD7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Brpf1B2RRD7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Brpf1B2RRD7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Brpf1B2RRD7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Brpf1B2RRD7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Brpf1B2RRD7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Brpf1B2RRD7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Brpf1B2RRD7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Brpf1B2RRD7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Brpf1B2RRD7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Brpf1B2RRD7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Brpf1B2RRD7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Brpf1B2RRD7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Brpf1B2RRD7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Brpf1B2RRD7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Brpf1B2RRD7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Brpf1B2RRD7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Brpf1B2RRD7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Brpf1B2RRD7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Brpf1B2RRD7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Brpf1B2RRD7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Brpf1B2RRD7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Brpf1B2RRD7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Brpf1B2RRD7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Brpf1B2RRD7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Brpf1B2RRD7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Brpf1B2RRD7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Brpf1B2RRD7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Brpf1B2RRD7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Brpf1B2RRD7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Brpf1B2RRD7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Brpf1B2RRD7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Brpf1B2RRD7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Brpf1B2RRD7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Brpf1B2RRD7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Brpf1B2RRD7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Brpf1B2RRD7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC30■■■□□ 2.39
Brpf1B2RRD7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Brpf1B2RRD7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Brpf1B2RRD7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Brpf1B2RRD7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Brpf1B2RRD7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Brpf1B2RRD7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Brpf1B2RRD7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Brpf1B2RRD7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Brpf1B2RRD7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Brpf1B2RRD7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Brpf1B2RRD7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Brpf1B2RRD7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Brpf1B2RRD7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Brpf1B2RRD7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Brpf1B2RRD7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Brpf1B2RRD7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Brpf1B2RRD7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Brpf1B2RRD7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Brpf1B2RRD7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Brpf1B2RRD7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Brpf1B2RRD7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Brpf1B2RRD7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Brpf1B2RRD7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Brpf1B2RRD7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Brpf1B2RRD7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Brpf1B2RRD7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Brpf1B2RRD7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Brpf1B2RRD7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Brpf1B2RRD7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Brpf1B2RRD7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Brpf1B2RRD7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Brpf1B2RRD7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Brpf1B2RRD7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Brpf1B2RRD7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Brpf1B2RRD7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Brpf1B2RRD7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Brpf1B2RRD7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Brpf1B2RRD7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Brpf1B2RRD7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Brpf1B2RRD7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Brpf1B2RRD7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Brpf1B2RRD7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Brpf1B2RRD7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Brpf1B2RRD7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Brpf1B2RRD7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Brpf1B2RRD7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Brpf1B2RRD7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Brpf1B2RRD7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Brpf1B2RRD7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Brpf1B2RRD7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Brpf1B2RRD7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms