Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zbed5B2RPU8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zbed5B2RPU8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zbed5B2RPU8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zbed5B2RPU8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zbed5B2RPU8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zbed5B2RPU8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zbed5B2RPU8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zbed5B2RPU8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zbed5B2RPU8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zbed5B2RPU8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zbed5B2RPU8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zbed5B2RPU8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zbed5B2RPU8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zbed5B2RPU8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zbed5B2RPU8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zbed5B2RPU8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zbed5B2RPU8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zbed5B2RPU8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Zbed5B2RPU8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zbed5B2RPU8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zbed5B2RPU8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zbed5B2RPU8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zbed5B2RPU8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zbed5B2RPU8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zbed5B2RPU8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zbed5B2RPU8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zbed5B2RPU8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zbed5B2RPU8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zbed5B2RPU8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zbed5B2RPU8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zbed5B2RPU8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zbed5B2RPU8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zbed5B2RPU8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zbed5B2RPU8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zbed5B2RPU8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zbed5B2RPU8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zbed5B2RPU8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zbed5B2RPU8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zbed5B2RPU8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zbed5B2RPU8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zbed5B2RPU8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Zbed5B2RPU8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zbed5B2RPU8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zbed5B2RPU8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zbed5B2RPU8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zbed5B2RPU8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zbed5B2RPU8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zbed5B2RPU8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zbed5B2RPU8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zbed5B2RPU8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zbed5B2RPU8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zbed5B2RPU8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Zbed5B2RPU8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zbed5B2RPU8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Zbed5B2RPU8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zbed5B2RPU8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zbed5B2RPU8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zbed5B2RPU8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zbed5B2RPU8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zbed5B2RPU8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zbed5B2RPU8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Zbed5B2RPU8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zbed5B2RPU8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zbed5B2RPU8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zbed5B2RPU8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zbed5B2RPU8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zbed5B2RPU8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zbed5B2RPU8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zbed5B2RPU8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zbed5B2RPU8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Zbed5B2RPU8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zbed5B2RPU8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zbed5B2RPU8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zbed5B2RPU8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zbed5B2RPU8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zbed5B2RPU8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zbed5B2RPU8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zbed5B2RPU8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Zbed5B2RPU8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zbed5B2RPU8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zbed5B2RPU8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zbed5B2RPU8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zbed5B2RPU8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zbed5B2RPU8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zbed5B2RPU8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zbed5B2RPU8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zbed5B2RPU8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zbed5B2RPU8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zbed5B2RPU8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zbed5B2RPU8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Zbed5B2RPU8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zbed5B2RPU8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zbed5B2RPU8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Zbed5B2RPU8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zbed5B2RPU8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zbed5B2RPU8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zbed5B2RPU8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zbed5B2RPU8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zbed5B2RPU8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms