Protein–RNA interactions for Protein: B1AZ99

Otud3, OTU domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud3B1AZ99 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Otud3B1AZ99 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Otud3B1AZ99 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Otud3B1AZ99 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Otud3B1AZ99 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Otud3B1AZ99 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Otud3B1AZ99 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Otud3B1AZ99 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Otud3B1AZ99 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Otud3B1AZ99 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Otud3B1AZ99 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Otud3B1AZ99 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Otud3B1AZ99 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Otud3B1AZ99 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Otud3B1AZ99 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Otud3B1AZ99 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Otud3B1AZ99 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Otud3B1AZ99 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Otud3B1AZ99 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Otud3B1AZ99 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Otud3B1AZ99 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Otud3B1AZ99 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Otud3B1AZ99 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Otud3B1AZ99 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Otud3B1AZ99 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Otud3B1AZ99 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Otud3B1AZ99 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Otud3B1AZ99 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Otud3B1AZ99 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Otud3B1AZ99 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Otud3B1AZ99 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Otud3B1AZ99 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Otud3B1AZ99 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Otud3B1AZ99 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Otud3B1AZ99 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Otud3B1AZ99 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Otud3B1AZ99 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Otud3B1AZ99 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Otud3B1AZ99 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Otud3B1AZ99 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Otud3B1AZ99 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Otud3B1AZ99 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Otud3B1AZ99 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Otud3B1AZ99 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Otud3B1AZ99 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Otud3B1AZ99 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Otud3B1AZ99 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Otud3B1AZ99 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Otud3B1AZ99 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Otud3B1AZ99 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Otud3B1AZ99 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Otud3B1AZ99 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Otud3B1AZ99 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Otud3B1AZ99 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Otud3B1AZ99 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Otud3B1AZ99 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Otud3B1AZ99 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Otud3B1AZ99 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Otud3B1AZ99 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Otud3B1AZ99 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Otud3B1AZ99 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Otud3B1AZ99 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Otud3B1AZ99 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Otud3B1AZ99 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Otud3B1AZ99 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Otud3B1AZ99 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Otud3B1AZ99 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Otud3B1AZ99 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Otud3B1AZ99 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Otud3B1AZ99 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Otud3B1AZ99 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Otud3B1AZ99 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Otud3B1AZ99 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Otud3B1AZ99 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Otud3B1AZ99 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Otud3B1AZ99 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Otud3B1AZ99 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Otud3B1AZ99 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Otud3B1AZ99 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Otud3B1AZ99 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Otud3B1AZ99 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23■■□□□ 1.27
Otud3B1AZ99 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Otud3B1AZ99 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Otud3B1AZ99 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Otud3B1AZ99 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Otud3B1AZ99 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Otud3B1AZ99 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Otud3B1AZ99 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Otud3B1AZ99 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Otud3B1AZ99 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Otud3B1AZ99 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Otud3B1AZ99 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Otud3B1AZ99 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Otud3B1AZ99 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Otud3B1AZ99 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Otud3B1AZ99 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Otud3B1AZ99 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Otud3B1AZ99 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Otud3B1AZ99 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Otud3B1AZ99 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms