Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slfn8B1ARD8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slfn8B1ARD8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slfn8B1ARD8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slfn8B1ARD8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slfn8B1ARD8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slfn8B1ARD8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slfn8B1ARD8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slfn8B1ARD8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slfn8B1ARD8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slfn8B1ARD8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slfn8B1ARD8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slfn8B1ARD8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Slfn8B1ARD8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Slfn8B1ARD8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slfn8B1ARD8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slfn8B1ARD8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slfn8B1ARD8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Slfn8B1ARD8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slfn8B1ARD8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slfn8B1ARD8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slfn8B1ARD8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slfn8B1ARD8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slfn8B1ARD8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slfn8B1ARD8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slfn8B1ARD8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slfn8B1ARD8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slfn8B1ARD8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slfn8B1ARD8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slfn8B1ARD8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slfn8B1ARD8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slfn8B1ARD8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slfn8B1ARD8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slfn8B1ARD8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slfn8B1ARD8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slfn8B1ARD8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Slfn8B1ARD8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slfn8B1ARD8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slfn8B1ARD8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slfn8B1ARD8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slfn8B1ARD8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slfn8B1ARD8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slfn8B1ARD8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slfn8B1ARD8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slfn8B1ARD8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slfn8B1ARD8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slfn8B1ARD8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slfn8B1ARD8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slfn8B1ARD8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slfn8B1ARD8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slfn8B1ARD8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slfn8B1ARD8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slfn8B1ARD8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Slfn8B1ARD8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slfn8B1ARD8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slfn8B1ARD8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slfn8B1ARD8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slfn8B1ARD8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slfn8B1ARD8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slfn8B1ARD8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slfn8B1ARD8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slfn8B1ARD8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slfn8B1ARD8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slfn8B1ARD8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slfn8B1ARD8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slfn8B1ARD8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Slfn8B1ARD8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slfn8B1ARD8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slfn8B1ARD8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slfn8B1ARD8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slfn8B1ARD8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slfn8B1ARD8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slfn8B1ARD8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slfn8B1ARD8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slfn8B1ARD8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slfn8B1ARD8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slfn8B1ARD8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slfn8B1ARD8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slfn8B1ARD8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slfn8B1ARD8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slfn8B1ARD8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slfn8B1ARD8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slfn8B1ARD8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slfn8B1ARD8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slfn8B1ARD8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slfn8B1ARD8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slfn8B1ARD8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slfn8B1ARD8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slfn8B1ARD8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slfn8B1ARD8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slfn8B1ARD8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slfn8B1ARD8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slfn8B1ARD8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slfn8B1ARD8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slfn8B1ARD8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slfn8B1ARD8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slfn8B1ARD8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slfn8B1ARD8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slfn8B1ARD8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slfn8B1ARD8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.8 ms