Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rhox1B1APN4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rhox1B1APN4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rhox1B1APN4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rhox1B1APN4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rhox1B1APN4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rhox1B1APN4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rhox1B1APN4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rhox1B1APN4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rhox1B1APN4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rhox1B1APN4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rhox1B1APN4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rhox1B1APN4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhox1B1APN4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhox1B1APN4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhox1B1APN4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhox1B1APN4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhox1B1APN4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhox1B1APN4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rhox1B1APN4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rhox1B1APN4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rhox1B1APN4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rhox1B1APN4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rhox1B1APN4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rhox1B1APN4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rhox1B1APN4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rhox1B1APN4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rhox1B1APN4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rhox1B1APN4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rhox1B1APN4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rhox1B1APN4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rhox1B1APN4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rhox1B1APN4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rhox1B1APN4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rhox1B1APN4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rhox1B1APN4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rhox1B1APN4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rhox1B1APN4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rhox1B1APN4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rhox1B1APN4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rhox1B1APN4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rhox1B1APN4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rhox1B1APN4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rhox1B1APN4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rhox1B1APN4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rhox1B1APN4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rhox1B1APN4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rhox1B1APN4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rhox1B1APN4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rhox1B1APN4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhox1B1APN4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhox1B1APN4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rhox1B1APN4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rhox1B1APN4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rhox1B1APN4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rhox1B1APN4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rhox1B1APN4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rhox1B1APN4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rhox1B1APN4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rhox1B1APN4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhox1B1APN4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhox1B1APN4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhox1B1APN4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhox1B1APN4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhox1B1APN4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rhox1B1APN4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rhox1B1APN4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rhox1B1APN4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rhox1B1APN4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rhox1B1APN4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rhox1B1APN4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhox1B1APN4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhox1B1APN4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhox1B1APN4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rhox1B1APN4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rhox1B1APN4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rhox1B1APN4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rhox1B1APN4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rhox1B1APN4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rhox1B1APN4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rhox1B1APN4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rhox1B1APN4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rhox1B1APN4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rhox1B1APN4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rhox1B1APN4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rhox1B1APN4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rhox1B1APN4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rhox1B1APN4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rhox1B1APN4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhox1B1APN4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhox1B1APN4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhox1B1APN4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhox1B1APN4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhox1B1APN4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rhox1B1APN4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rhox1B1APN4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhox1B1APN4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhox1B1APN4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhox1B1APN4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rhox1B1APN4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms