Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Skint2A7XUX6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Skint2A7XUX6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Skint2A7XUX6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skint2A7XUX6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skint2A7XUX6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skint2A7XUX6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skint2A7XUX6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skint2A7XUX6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skint2A7XUX6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Skint2A7XUX6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Skint2A7XUX6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Skint2A7XUX6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Skint2A7XUX6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Skint2A7XUX6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Skint2A7XUX6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Skint2A7XUX6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Skint2A7XUX6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Skint2A7XUX6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Skint2A7XUX6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Skint2A7XUX6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Skint2A7XUX6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Skint2A7XUX6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Skint2A7XUX6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Skint2A7XUX6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Skint2A7XUX6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Skint2A7XUX6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Skint2A7XUX6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Skint2A7XUX6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Skint2A7XUX6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Skint2A7XUX6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Skint2A7XUX6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Skint2A7XUX6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Skint2A7XUX6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Skint2A7XUX6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Skint2A7XUX6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Skint2A7XUX6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Skint2A7XUX6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Skint2A7XUX6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Skint2A7XUX6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Skint2A7XUX6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Skint2A7XUX6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Skint2A7XUX6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Skint2A7XUX6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Skint2A7XUX6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Skint2A7XUX6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Skint2A7XUX6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Skint2A7XUX6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Skint2A7XUX6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Skint2A7XUX6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Skint2A7XUX6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Skint2A7XUX6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Skint2A7XUX6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Skint2A7XUX6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Skint2A7XUX6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Skint2A7XUX6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Skint2A7XUX6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Skint2A7XUX6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Skint2A7XUX6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Skint2A7XUX6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Skint2A7XUX6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Skint2A7XUX6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Skint2A7XUX6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Skint2A7XUX6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Skint2A7XUX6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Skint2A7XUX6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Skint2A7XUX6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Skint2A7XUX6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Skint2A7XUX6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Skint2A7XUX6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Skint2A7XUX6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Skint2A7XUX6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Skint2A7XUX6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Skint2A7XUX6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Skint2A7XUX6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Skint2A7XUX6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Skint2A7XUX6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Skint2A7XUX6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Skint2A7XUX6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Skint2A7XUX6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Skint2A7XUX6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Skint2A7XUX6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Skint2A7XUX6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Skint2A7XUX6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Skint2A7XUX6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Skint2A7XUX6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Skint2A7XUX6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Skint2A7XUX6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Skint2A7XUX6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Skint2A7XUX6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Skint2A7XUX6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Skint2A7XUX6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Skint2A7XUX6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Skint2A7XUX6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Skint2A7XUX6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Skint2A7XUX6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Skint2A7XUX6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Skint2A7XUX6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Skint2A7XUX6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Skint2A7XUX6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms