Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF0

Skint3, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint3A7TZF0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Skint3A7TZF0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Skint3A7TZF0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Skint3A7TZF0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Skint3A7TZF0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Skint3A7TZF0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Skint3A7TZF0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Skint3A7TZF0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Skint3A7TZF0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Skint3A7TZF0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Skint3A7TZF0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Skint3A7TZF0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Skint3A7TZF0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Skint3A7TZF0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Skint3A7TZF0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Skint3A7TZF0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Skint3A7TZF0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Skint3A7TZF0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Skint3A7TZF0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Skint3A7TZF0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Skint3A7TZF0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Skint3A7TZF0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Skint3A7TZF0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Skint3A7TZF0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Skint3A7TZF0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Skint3A7TZF0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Skint3A7TZF0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Skint3A7TZF0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Skint3A7TZF0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Skint3A7TZF0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Skint3A7TZF0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Skint3A7TZF0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Skint3A7TZF0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Skint3A7TZF0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Skint3A7TZF0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Skint3A7TZF0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Skint3A7TZF0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Skint3A7TZF0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Skint3A7TZF0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Skint3A7TZF0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Skint3A7TZF0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Skint3A7TZF0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Skint3A7TZF0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Skint3A7TZF0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Skint3A7TZF0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Skint3A7TZF0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Skint3A7TZF0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Skint3A7TZF0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Skint3A7TZF0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Skint3A7TZF0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Skint3A7TZF0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Skint3A7TZF0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Skint3A7TZF0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Skint3A7TZF0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Skint3A7TZF0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Skint3A7TZF0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Skint3A7TZF0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Skint3A7TZF0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Skint3A7TZF0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Skint3A7TZF0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Skint3A7TZF0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Skint3A7TZF0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Skint3A7TZF0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Skint3A7TZF0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Skint3A7TZF0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Skint3A7TZF0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Skint3A7TZF0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Skint3A7TZF0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Skint3A7TZF0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Skint3A7TZF0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Skint3A7TZF0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Skint3A7TZF0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Skint3A7TZF0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Skint3A7TZF0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Skint3A7TZF0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Skint3A7TZF0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Skint3A7TZF0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Skint3A7TZF0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Skint3A7TZF0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Skint3A7TZF0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Skint3A7TZF0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Skint3A7TZF0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Skint3A7TZF0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Skint3A7TZF0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Skint3A7TZF0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Skint3A7TZF0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Skint3A7TZF0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Skint3A7TZF0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Skint3A7TZF0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Skint3A7TZF0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Skint3A7TZF0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Skint3A7TZF0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Skint3A7TZF0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Skint3A7TZF0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Skint3A7TZF0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Skint3A7TZF0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Skint3A7TZF0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Skint3A7TZF0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Skint3A7TZF0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Skint3A7TZF0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms