Protein–RNA interactions for Protein: A2BI45

Xlr5a, X-linked lymphocyte-regulated 5A, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr5aA2BI45 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xlr5aA2BI45 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xlr5aA2BI45 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xlr5aA2BI45 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xlr5aA2BI45 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xlr5aA2BI45 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xlr5aA2BI45 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xlr5aA2BI45 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xlr5aA2BI45 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xlr5aA2BI45 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xlr5aA2BI45 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xlr5aA2BI45 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xlr5aA2BI45 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xlr5aA2BI45 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xlr5aA2BI45 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xlr5aA2BI45 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xlr5aA2BI45 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xlr5aA2BI45 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xlr5aA2BI45 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xlr5aA2BI45 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xlr5aA2BI45 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xlr5aA2BI45 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xlr5aA2BI45 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Xlr5aA2BI45 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xlr5aA2BI45 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xlr5aA2BI45 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xlr5aA2BI45 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Xlr5aA2BI45 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Xlr5aA2BI45 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Xlr5aA2BI45 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Xlr5aA2BI45 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Xlr5aA2BI45 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Xlr5aA2BI45 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xlr5aA2BI45 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xlr5aA2BI45 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Xlr5aA2BI45 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Xlr5aA2BI45 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Xlr5aA2BI45 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Xlr5aA2BI45 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xlr5aA2BI45 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Xlr5aA2BI45 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Xlr5aA2BI45 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Xlr5aA2BI45 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Xlr5aA2BI45 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Xlr5aA2BI45 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Xlr5aA2BI45 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Xlr5aA2BI45 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Xlr5aA2BI45 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Xlr5aA2BI45 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xlr5aA2BI45 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xlr5aA2BI45 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xlr5aA2BI45 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xlr5aA2BI45 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xlr5aA2BI45 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xlr5aA2BI45 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Xlr5aA2BI45 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Xlr5aA2BI45 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Xlr5aA2BI45 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Xlr5aA2BI45 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Xlr5aA2BI45 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Xlr5aA2BI45 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Xlr5aA2BI45 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Xlr5aA2BI45 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xlr5aA2BI45 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xlr5aA2BI45 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xlr5aA2BI45 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xlr5aA2BI45 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xlr5aA2BI45 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xlr5aA2BI45 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xlr5aA2BI45 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xlr5aA2BI45 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xlr5aA2BI45 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xlr5aA2BI45 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xlr5aA2BI45 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xlr5aA2BI45 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Xlr5aA2BI45 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xlr5aA2BI45 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xlr5aA2BI45 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Xlr5aA2BI45 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xlr5aA2BI45 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xlr5aA2BI45 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xlr5aA2BI45 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xlr5aA2BI45 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xlr5aA2BI45 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Xlr5aA2BI45 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Xlr5aA2BI45 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xlr5aA2BI45 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xlr5aA2BI45 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xlr5aA2BI45 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Xlr5aA2BI45 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xlr5aA2BI45 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Xlr5aA2BI45 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xlr5aA2BI45 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Xlr5aA2BI45 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xlr5aA2BI45 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xlr5aA2BI45 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xlr5aA2BI45 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Xlr5aA2BI45 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xlr5aA2BI45 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Xlr5aA2BI45 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms