Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2al1jA2BFR3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2al1jA2BFR3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
H2al1jA2BFR3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2al1jA2BFR3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2al1jA2BFR3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2al1jA2BFR3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2al1jA2BFR3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2al1jA2BFR3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2al1jA2BFR3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2al1jA2BFR3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2al1jA2BFR3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2al1jA2BFR3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2al1jA2BFR3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2al1jA2BFR3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2al1jA2BFR3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2al1jA2BFR3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2al1jA2BFR3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2al1jA2BFR3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2al1jA2BFR3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2al1jA2BFR3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2al1jA2BFR3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2al1jA2BFR3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2al1jA2BFR3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2al1jA2BFR3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2al1jA2BFR3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2al1jA2BFR3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2al1jA2BFR3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2al1jA2BFR3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
H2al1jA2BFR3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2al1jA2BFR3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2al1jA2BFR3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2al1jA2BFR3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2al1jA2BFR3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2al1jA2BFR3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2al1jA2BFR3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2al1jA2BFR3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2al1jA2BFR3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2al1jA2BFR3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2al1jA2BFR3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2al1jA2BFR3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2al1jA2BFR3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2al1jA2BFR3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2al1jA2BFR3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2al1jA2BFR3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
H2al1jA2BFR3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2al1jA2BFR3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2al1jA2BFR3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2al1jA2BFR3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2al1jA2BFR3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2al1jA2BFR3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2al1jA2BFR3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2al1jA2BFR3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2al1jA2BFR3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2al1jA2BFR3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2al1jA2BFR3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2al1jA2BFR3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2al1jA2BFR3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2al1jA2BFR3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2al1jA2BFR3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2al1jA2BFR3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2al1jA2BFR3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2al1jA2BFR3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2al1jA2BFR3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2al1jA2BFR3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2al1jA2BFR3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2al1jA2BFR3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2al1jA2BFR3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2al1jA2BFR3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
H2al1jA2BFR3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2al1jA2BFR3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2al1jA2BFR3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2al1jA2BFR3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2al1jA2BFR3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2al1jA2BFR3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2al1jA2BFR3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2al1jA2BFR3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2al1jA2BFR3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2al1jA2BFR3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2al1jA2BFR3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2al1jA2BFR3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2al1jA2BFR3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2al1jA2BFR3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2al1jA2BFR3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2al1jA2BFR3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2al1jA2BFR3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2al1jA2BFR3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2al1jA2BFR3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2al1jA2BFR3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2al1jA2BFR3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
H2al1jA2BFR3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2al1jA2BFR3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2al1jA2BFR3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2al1jA2BFR3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2al1jA2BFR3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2al1jA2BFR3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2al1jA2BFR3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2al1jA2BFR3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2al1jA2BFR3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2al1jA2BFR3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms