Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samt1A2BED8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Samt1A2BED8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Samt1A2BED8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samt1A2BED8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samt1A2BED8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samt1A2BED8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samt1A2BED8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samt1A2BED8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samt1A2BED8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Samt1A2BED8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Samt1A2BED8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samt1A2BED8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samt1A2BED8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samt1A2BED8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samt1A2BED8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samt1A2BED8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samt1A2BED8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samt1A2BED8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samt1A2BED8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samt1A2BED8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samt1A2BED8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samt1A2BED8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samt1A2BED8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samt1A2BED8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samt1A2BED8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samt1A2BED8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samt1A2BED8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samt1A2BED8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samt1A2BED8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samt1A2BED8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samt1A2BED8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samt1A2BED8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samt1A2BED8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samt1A2BED8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samt1A2BED8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Samt1A2BED8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Samt1A2BED8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Samt1A2BED8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Samt1A2BED8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samt1A2BED8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samt1A2BED8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samt1A2BED8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samt1A2BED8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Samt1A2BED8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Samt1A2BED8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Samt1A2BED8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Samt1A2BED8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samt1A2BED8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Samt1A2BED8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samt1A2BED8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samt1A2BED8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samt1A2BED8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samt1A2BED8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samt1A2BED8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samt1A2BED8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samt1A2BED8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samt1A2BED8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samt1A2BED8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samt1A2BED8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samt1A2BED8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samt1A2BED8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samt1A2BED8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samt1A2BED8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Samt1A2BED8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samt1A2BED8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samt1A2BED8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samt1A2BED8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samt1A2BED8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samt1A2BED8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samt1A2BED8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samt1A2BED8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samt1A2BED8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Samt1A2BED8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samt1A2BED8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samt1A2BED8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samt1A2BED8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samt1A2BED8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samt1A2BED8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samt1A2BED8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samt1A2BED8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samt1A2BED8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samt1A2BED8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samt1A2BED8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samt1A2BED8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samt1A2BED8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samt1A2BED8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samt1A2BED8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samt1A2BED8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samt1A2BED8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samt1A2BED8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samt1A2BED8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samt1A2BED8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samt1A2BED8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samt1A2BED8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samt1A2BED8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samt1A2BED8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samt1A2BED8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samt1A2BED8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samt1A2BED8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.6 ms