Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tubb1A2AQ07 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tubb1A2AQ07 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tubb1A2AQ07 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tubb1A2AQ07 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tubb1A2AQ07 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tubb1A2AQ07 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tubb1A2AQ07 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tubb1A2AQ07 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tubb1A2AQ07 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tubb1A2AQ07 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tubb1A2AQ07 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tubb1A2AQ07 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tubb1A2AQ07 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tubb1A2AQ07 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tubb1A2AQ07 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tubb1A2AQ07 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tubb1A2AQ07 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tubb1A2AQ07 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tubb1A2AQ07 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tubb1A2AQ07 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tubb1A2AQ07 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tubb1A2AQ07 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tubb1A2AQ07 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tubb1A2AQ07 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tubb1A2AQ07 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tubb1A2AQ07 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tubb1A2AQ07 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tubb1A2AQ07 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tubb1A2AQ07 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Tubb1A2AQ07 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tubb1A2AQ07 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tubb1A2AQ07 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Tubb1A2AQ07 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tubb1A2AQ07 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tubb1A2AQ07 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tubb1A2AQ07 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tubb1A2AQ07 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tubb1A2AQ07 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tubb1A2AQ07 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tubb1A2AQ07 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tubb1A2AQ07 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tubb1A2AQ07 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tubb1A2AQ07 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tubb1A2AQ07 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubb1A2AQ07 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubb1A2AQ07 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tubb1A2AQ07 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tubb1A2AQ07 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tubb1A2AQ07 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tubb1A2AQ07 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tubb1A2AQ07 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tubb1A2AQ07 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tubb1A2AQ07 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tubb1A2AQ07 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tubb1A2AQ07 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tubb1A2AQ07 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tubb1A2AQ07 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tubb1A2AQ07 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tubb1A2AQ07 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tubb1A2AQ07 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tubb1A2AQ07 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Tubb1A2AQ07 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tubb1A2AQ07 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tubb1A2AQ07 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tubb1A2AQ07 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tubb1A2AQ07 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tubb1A2AQ07 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tubb1A2AQ07 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tubb1A2AQ07 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tubb1A2AQ07 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubb1A2AQ07 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tubb1A2AQ07 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tubb1A2AQ07 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tubb1A2AQ07 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tubb1A2AQ07 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubb1A2AQ07 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tubb1A2AQ07 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Tubb1A2AQ07 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tubb1A2AQ07 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tubb1A2AQ07 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tubb1A2AQ07 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tubb1A2AQ07 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubb1A2AQ07 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubb1A2AQ07 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tubb1A2AQ07 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tubb1A2AQ07 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tubb1A2AQ07 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tubb1A2AQ07 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tubb1A2AQ07 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Tubb1A2AQ07 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tubb1A2AQ07 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Tubb1A2AQ07 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubb1A2AQ07 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubb1A2AQ07 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubb1A2AQ07 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tubb1A2AQ07 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubb1A2AQ07 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tubb1A2AQ07 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tubb1A2AQ07 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms