Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtcflA2APF3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtcflA2APF3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtcflA2APF3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtcflA2APF3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtcflA2APF3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtcflA2APF3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtcflA2APF3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtcflA2APF3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtcflA2APF3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtcflA2APF3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtcflA2APF3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtcflA2APF3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtcflA2APF3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtcflA2APF3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtcflA2APF3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtcflA2APF3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtcflA2APF3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CtcflA2APF3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CtcflA2APF3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CtcflA2APF3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CtcflA2APF3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CtcflA2APF3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CtcflA2APF3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CtcflA2APF3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CtcflA2APF3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CtcflA2APF3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CtcflA2APF3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CtcflA2APF3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CtcflA2APF3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CtcflA2APF3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CtcflA2APF3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CtcflA2APF3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtcflA2APF3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtcflA2APF3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtcflA2APF3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtcflA2APF3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtcflA2APF3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtcflA2APF3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtcflA2APF3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CtcflA2APF3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CtcflA2APF3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CtcflA2APF3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CtcflA2APF3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CtcflA2APF3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CtcflA2APF3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CtcflA2APF3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CtcflA2APF3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CtcflA2APF3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CtcflA2APF3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CtcflA2APF3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CtcflA2APF3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CtcflA2APF3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CtcflA2APF3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CtcflA2APF3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CtcflA2APF3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CtcflA2APF3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CtcflA2APF3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtcflA2APF3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtcflA2APF3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtcflA2APF3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtcflA2APF3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtcflA2APF3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtcflA2APF3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CtcflA2APF3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CtcflA2APF3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtcflA2APF3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtcflA2APF3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtcflA2APF3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtcflA2APF3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CtcflA2APF3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CtcflA2APF3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CtcflA2APF3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtcflA2APF3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtcflA2APF3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtcflA2APF3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtcflA2APF3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtcflA2APF3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtcflA2APF3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtcflA2APF3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtcflA2APF3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CtcflA2APF3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtcflA2APF3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtcflA2APF3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtcflA2APF3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtcflA2APF3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtcflA2APF3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtcflA2APF3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtcflA2APF3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CtcflA2APF3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtcflA2APF3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtcflA2APF3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtcflA2APF3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtcflA2APF3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtcflA2APF3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtcflA2APF3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CtcflA2APF3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtcflA2APF3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtcflA2APF3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtcflA2APF3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.5 ms