Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ76

Hmcn2, Hemicentin-2, mousemouse

Predictions only

Length 5,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmcn2A2AJ76 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hmcn2A2AJ76 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hmcn2A2AJ76 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hmcn2A2AJ76 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hmcn2A2AJ76 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hmcn2A2AJ76 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hmcn2A2AJ76 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hmcn2A2AJ76 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hmcn2A2AJ76 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hmcn2A2AJ76 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Hmcn2A2AJ76 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Hmcn2A2AJ76 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmcn2A2AJ76 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmcn2A2AJ76 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmcn2A2AJ76 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmcn2A2AJ76 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmcn2A2AJ76 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hmcn2A2AJ76 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmcn2A2AJ76 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmcn2A2AJ76 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmcn2A2AJ76 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hmcn2A2AJ76 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmcn2A2AJ76 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmcn2A2AJ76 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hmcn2A2AJ76 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmcn2A2AJ76 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmcn2A2AJ76 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hmcn2A2AJ76 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmcn2A2AJ76 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmcn2A2AJ76 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmcn2A2AJ76 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmcn2A2AJ76 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmcn2A2AJ76 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hmcn2A2AJ76 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmcn2A2AJ76 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmcn2A2AJ76 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmcn2A2AJ76 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmcn2A2AJ76 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmcn2A2AJ76 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmcn2A2AJ76 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmcn2A2AJ76 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmcn2A2AJ76 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmcn2A2AJ76 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmcn2A2AJ76 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmcn2A2AJ76 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmcn2A2AJ76 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmcn2A2AJ76 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmcn2A2AJ76 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmcn2A2AJ76 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmcn2A2AJ76 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmcn2A2AJ76 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmcn2A2AJ76 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmcn2A2AJ76 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmcn2A2AJ76 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmcn2A2AJ76 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmcn2A2AJ76 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmcn2A2AJ76 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmcn2A2AJ76 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmcn2A2AJ76 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmcn2A2AJ76 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmcn2A2AJ76 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmcn2A2AJ76 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmcn2A2AJ76 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmcn2A2AJ76 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmcn2A2AJ76 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmcn2A2AJ76 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmcn2A2AJ76 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmcn2A2AJ76 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmcn2A2AJ76 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hmcn2A2AJ76 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmcn2A2AJ76 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmcn2A2AJ76 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmcn2A2AJ76 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmcn2A2AJ76 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmcn2A2AJ76 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hmcn2A2AJ76 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmcn2A2AJ76 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmcn2A2AJ76 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmcn2A2AJ76 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hmcn2A2AJ76 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmcn2A2AJ76 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmcn2A2AJ76 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hmcn2A2AJ76 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmcn2A2AJ76 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmcn2A2AJ76 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hmcn2A2AJ76 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmcn2A2AJ76 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hmcn2A2AJ76 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmcn2A2AJ76 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmcn2A2AJ76 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmcn2A2AJ76 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmcn2A2AJ76 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmcn2A2AJ76 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmcn2A2AJ76 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmcn2A2AJ76 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmcn2A2AJ76 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmcn2A2AJ76 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmcn2A2AJ76 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmcn2A2AJ76 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmcn2A2AJ76 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms