Protein–RNA interactions for Protein: A2AGH5

Gm20489, Predicted gene 20489, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20489A2AGH5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20489A2AGH5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20489A2AGH5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20489A2AGH5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20489A2AGH5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm20489A2AGH5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm20489A2AGH5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm20489A2AGH5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm20489A2AGH5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20489A2AGH5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20489A2AGH5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm20489A2AGH5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm20489A2AGH5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm20489A2AGH5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20489A2AGH5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20489A2AGH5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20489A2AGH5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20489A2AGH5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20489A2AGH5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20489A2AGH5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20489A2AGH5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20489A2AGH5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm20489A2AGH5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm20489A2AGH5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm20489A2AGH5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm20489A2AGH5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm20489A2AGH5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm20489A2AGH5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm20489A2AGH5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm20489A2AGH5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm20489A2AGH5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm20489A2AGH5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm20489A2AGH5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm20489A2AGH5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm20489A2AGH5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm20489A2AGH5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm20489A2AGH5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm20489A2AGH5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm20489A2AGH5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm20489A2AGH5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm20489A2AGH5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm20489A2AGH5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm20489A2AGH5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm20489A2AGH5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm20489A2AGH5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm20489A2AGH5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm20489A2AGH5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm20489A2AGH5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm20489A2AGH5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm20489A2AGH5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm20489A2AGH5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm20489A2AGH5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm20489A2AGH5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm20489A2AGH5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm20489A2AGH5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm20489A2AGH5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm20489A2AGH5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm20489A2AGH5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm20489A2AGH5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm20489A2AGH5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm20489A2AGH5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm20489A2AGH5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm20489A2AGH5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm20489A2AGH5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm20489A2AGH5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm20489A2AGH5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm20489A2AGH5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm20489A2AGH5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm20489A2AGH5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm20489A2AGH5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm20489A2AGH5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm20489A2AGH5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm20489A2AGH5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm20489A2AGH5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm20489A2AGH5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm20489A2AGH5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm20489A2AGH5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm20489A2AGH5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm20489A2AGH5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm20489A2AGH5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm20489A2AGH5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm20489A2AGH5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm20489A2AGH5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm20489A2AGH5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm20489A2AGH5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm20489A2AGH5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm20489A2AGH5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm20489A2AGH5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm20489A2AGH5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm20489A2AGH5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm20489A2AGH5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm20489A2AGH5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm20489A2AGH5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm20489A2AGH5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm20489A2AGH5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm20489A2AGH5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm20489A2AGH5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm20489A2AGH5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm20489A2AGH5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm20489A2AGH5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms