Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc163A2AGD7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc163A2AGD7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc163A2AGD7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc163A2AGD7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc163A2AGD7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc163A2AGD7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc163A2AGD7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc163A2AGD7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc163A2AGD7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc163A2AGD7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc163A2AGD7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc163A2AGD7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc163A2AGD7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc163A2AGD7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc163A2AGD7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc163A2AGD7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc163A2AGD7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc163A2AGD7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc163A2AGD7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc163A2AGD7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc163A2AGD7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc163A2AGD7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc163A2AGD7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc163A2AGD7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc163A2AGD7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc163A2AGD7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc163A2AGD7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc163A2AGD7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc163A2AGD7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc163A2AGD7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc163A2AGD7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc163A2AGD7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc163A2AGD7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc163A2AGD7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc163A2AGD7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc163A2AGD7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc163A2AGD7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc163A2AGD7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc163A2AGD7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc163A2AGD7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc163A2AGD7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc163A2AGD7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc163A2AGD7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc163A2AGD7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc163A2AGD7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc163A2AGD7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc163A2AGD7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc163A2AGD7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc163A2AGD7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc163A2AGD7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc163A2AGD7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc163A2AGD7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc163A2AGD7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc163A2AGD7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc163A2AGD7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc163A2AGD7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc163A2AGD7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc163A2AGD7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc163A2AGD7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc163A2AGD7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc163A2AGD7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc163A2AGD7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc163A2AGD7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc163A2AGD7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc163A2AGD7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc163A2AGD7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc163A2AGD7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc163A2AGD7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc163A2AGD7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc163A2AGD7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc163A2AGD7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc163A2AGD7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc163A2AGD7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc163A2AGD7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc163A2AGD7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc163A2AGD7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc163A2AGD7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc163A2AGD7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc163A2AGD7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc163A2AGD7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc163A2AGD7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc163A2AGD7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc163A2AGD7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc163A2AGD7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc163A2AGD7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc163A2AGD7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc163A2AGD7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc163A2AGD7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc163A2AGD7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc163A2AGD7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc163A2AGD7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc163A2AGD7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc163A2AGD7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc163A2AGD7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc163A2AGD7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc163A2AGD7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc163A2AGD7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc163A2AGD7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc163A2AGD7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms