Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprfA2A8L5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprfA2A8L5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprfA2A8L5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtprfA2A8L5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprfA2A8L5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprfA2A8L5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtprfA2A8L5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprfA2A8L5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtprfA2A8L5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtprfA2A8L5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprfA2A8L5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprfA2A8L5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprfA2A8L5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprfA2A8L5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtprfA2A8L5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprfA2A8L5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtprfA2A8L5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprfA2A8L5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprfA2A8L5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtprfA2A8L5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprfA2A8L5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprfA2A8L5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprfA2A8L5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprfA2A8L5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprfA2A8L5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprfA2A8L5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtprfA2A8L5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprfA2A8L5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprfA2A8L5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprfA2A8L5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprfA2A8L5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprfA2A8L5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprfA2A8L5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprfA2A8L5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprfA2A8L5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PtprfA2A8L5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprfA2A8L5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprfA2A8L5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprfA2A8L5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprfA2A8L5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprfA2A8L5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtprfA2A8L5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtprfA2A8L5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprfA2A8L5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprfA2A8L5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprfA2A8L5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprfA2A8L5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprfA2A8L5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprfA2A8L5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprfA2A8L5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PtprfA2A8L5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PtprfA2A8L5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprfA2A8L5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprfA2A8L5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprfA2A8L5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprfA2A8L5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprfA2A8L5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprfA2A8L5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprfA2A8L5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprfA2A8L5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprfA2A8L5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprfA2A8L5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprfA2A8L5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprfA2A8L5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprfA2A8L5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprfA2A8L5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprfA2A8L5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PtprfA2A8L5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtprfA2A8L5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtprfA2A8L5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtprfA2A8L5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtprfA2A8L5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprfA2A8L5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprfA2A8L5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PtprfA2A8L5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PtprfA2A8L5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprfA2A8L5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprfA2A8L5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprfA2A8L5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprfA2A8L5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprfA2A8L5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprfA2A8L5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprfA2A8L5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprfA2A8L5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprfA2A8L5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprfA2A8L5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PtprfA2A8L5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprfA2A8L5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PtprfA2A8L5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PtprfA2A8L5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PtprfA2A8L5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PtprfA2A8L5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtprfA2A8L5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtprfA2A8L5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtprfA2A8L5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtprfA2A8L5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PtprfA2A8L5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PtprfA2A8L5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PtprfA2A8L5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms