Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LI88

Ankrd31, Ankyrin repeat domain 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd31A0A140LI88 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ankrd31A0A140LI88 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ankrd31A0A140LI88 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ankrd31A0A140LI88 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ankrd31A0A140LI88 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ankrd31A0A140LI88 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ankrd31A0A140LI88 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ankrd31A0A140LI88 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Ankrd31A0A140LI88 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ankrd31A0A140LI88 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ankrd31A0A140LI88 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ankrd31A0A140LI88 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ankrd31A0A140LI88 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ankrd31A0A140LI88 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ankrd31A0A140LI88 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ankrd31A0A140LI88 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ankrd31A0A140LI88 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ankrd31A0A140LI88 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ankrd31A0A140LI88 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ankrd31A0A140LI88 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ankrd31A0A140LI88 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ankrd31A0A140LI88 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ankrd31A0A140LI88 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ankrd31A0A140LI88 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ankrd31A0A140LI88 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ankrd31A0A140LI88 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ankrd31A0A140LI88 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ankrd31A0A140LI88 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ankrd31A0A140LI88 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ankrd31A0A140LI88 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ankrd31A0A140LI88 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ankrd31A0A140LI88 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ankrd31A0A140LI88 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Ankrd31A0A140LI88 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ankrd31A0A140LI88 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ankrd31A0A140LI88 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Ankrd31A0A140LI88 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Ankrd31A0A140LI88 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ankrd31A0A140LI88 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ankrd31A0A140LI88 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ankrd31A0A140LI88 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ankrd31A0A140LI88 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ankrd31A0A140LI88 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ankrd31A0A140LI88 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ankrd31A0A140LI88 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ankrd31A0A140LI88 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ankrd31A0A140LI88 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ankrd31A0A140LI88 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ankrd31A0A140LI88 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ankrd31A0A140LI88 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ankrd31A0A140LI88 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ankrd31A0A140LI88 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ankrd31A0A140LI88 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ankrd31A0A140LI88 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ankrd31A0A140LI88 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ankrd31A0A140LI88 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ankrd31A0A140LI88 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ankrd31A0A140LI88 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ankrd31A0A140LI88 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ankrd31A0A140LI88 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ankrd31A0A140LI88 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ankrd31A0A140LI88 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ankrd31A0A140LI88 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ankrd31A0A140LI88 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ankrd31A0A140LI88 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ankrd31A0A140LI88 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ankrd31A0A140LI88 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Ankrd31A0A140LI88 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ankrd31A0A140LI88 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ankrd31A0A140LI88 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ankrd31A0A140LI88 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ankrd31A0A140LI88 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ankrd31A0A140LI88 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ankrd31A0A140LI88 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ankrd31A0A140LI88 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ankrd31A0A140LI88 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ankrd31A0A140LI88 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ankrd31A0A140LI88 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ankrd31A0A140LI88 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ankrd31A0A140LI88 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ankrd31A0A140LI88 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ankrd31A0A140LI88 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ankrd31A0A140LI88 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ankrd31A0A140LI88 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ankrd31A0A140LI88 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ankrd31A0A140LI88 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ankrd31A0A140LI88 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ankrd31A0A140LI88 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ankrd31A0A140LI88 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Ankrd31A0A140LI88 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ankrd31A0A140LI88 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ankrd31A0A140LI88 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ankrd31A0A140LI88 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ankrd31A0A140LI88 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ankrd31A0A140LI88 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ankrd31A0A140LI88 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ankrd31A0A140LI88 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ankrd31A0A140LI88 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ankrd31A0A140LI88 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ankrd31A0A140LI88 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms