Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.29■■□□□ 1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
6430628N08RikA0A0U1RQ45 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
6430628N08RikA0A0U1RQ45 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
6430628N08RikA0A0U1RQ45 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
6430628N08RikA0A0U1RQ45 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.1 ms