Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trbv13-1A0A0B4J1P8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trbv13-1A0A0B4J1P8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trbv13-1A0A0B4J1P8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trbv13-1A0A0B4J1P8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trbv13-1A0A0B4J1P8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trbv13-1A0A0B4J1P8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trbv13-1A0A0B4J1P8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trbv13-1A0A0B4J1P8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms